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不論是highlights還是links,展示的都是染色體上某段區域的資訊，在實際的資料中，除了區間資訊外，還會有該區間對應的資料資訊，比如測序深度等資訊。對於這種資訊，通常我們會通過散點圖，折線圖等圖表來展現，在circos中，也有對應的功能，通過plots這個block ， 可以在資料對映到二維座標系中，然後通過不同的圖表型別來呈現。

plots需要的資料格式如下

共4列，空格分隔；前3列定義座標，包括染色體，起始和終止位置；第4列定義對應的值。在這個檔案中，有兩點需要注意

1. 區間資訊可以是一個點，檔案的第2列和第3列定義起始和終止位置，但是起始和終止位置可以相同；
2. 第四列的資訊不僅是數字，也可以是文字。數值可以使用散點圖等展現形式，文字可以直接標記在圖上。

plots的基本用法如下：

在circos中，基本都是通過一個圓環來展示資料的，r0和r1分別定義圓環的內徑和外徑，肯定是必須的。這裡有兩個新的引數max和min, 對於散點圖等圖表來說，是需要一個座標系的 ，file檔案中的前3列定義了橫座標，縱座標就是通過這裡的max和min來定義；max和min分別定義了縱軸的最小值和最大值，通過將file檔案中的第四列的值對映到這個範圍，就可以確定在圖上的位置。

type定義圖表型別，對於plots而言，有以下型別

1. scatter

scatter代表散點圖， 展現形似如下

2. line

line 代表折線圖， 展現形式如下

3. histogram

histogram代表直方圖，展現形式如下：

4. heatmap

heatmap代表熱圖，展現形式如下

5. text

text 直接在圖上標記文字，展現形式如下

在plots 中，還有兩個比較特殊的圖表型別，其資料格式和之前的幾種型別都不太一樣。

1 . tile

tile用於展示染色體區域分佈，通過邊距，使得相鄰區域不會重疊，其展現形式如下：

2. connector

connector用於展示染色體上兩個位置之間的聯絡，它需要的檔案格式有點特殊，後續我會詳細講述，其展現形式如下：

上述就是plot的基本概念和展現形式。在實際使用中，plots還可以結合backgrounds, axes, rules 來使用，使圖片更加美觀。

由於plots中的圖表型別過多，每種型別又有很多的細節，針對每種圖表型別，在接下來的文章中再單獨介紹。

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