如何從ZINC資料庫下載小分子用於虛擬篩選
阿新 • • 發佈:2020-10-09
ZINC改版了,最新版跟幾年前我用的版本大不一樣,於是查了一下資料,整理了一個教程
參考視訊:https://www.youtube.com/watch?v=zloEnrWGqAg
1.點選Tranches,可以看到有很多選項,根據需求選擇合適的分類,點選下載,我選擇sdf格式的下載,下載方式選擇powershell,將檔案下載到桌面,放在screening資料夾裡,並修改檔名為ligands.ps1;
2.開始選單欄輸入Powershell,右鍵,以管理員身份執行;
3.切換資料夾,輸入ls,看users資料夾中的所有資料夾;
然後cd "想進入的資料夾名"
最後cd Desktop進入桌面資料夾
cd Screening進入篩選資料夾
輸入ls,看screening資料夾裡面有什麼;
輸入Set-ExecutionPolicy Unrestricted
選擇 Yes to all
輸入.\ligands.ps1,回車後,選擇run once;
完成後,輸入Set-ExecutionPolicy Unrestricted
3.以上步驟會在Screening資料夾下生成新的資料夾,視訊中是兩個,也可能更多
新建資料夾ligands
搜尋框輸入.gz
開啟解壓縮工具ExtractNow
將檔案拖入ExtractNow
點選Extract,選擇ligands資料夾,點選Ok to all。
開啟ligands資料夾,裡面的檔案就是下載的sdf格式