技術標籤：從頭開始學核磁——從入門到放棄fMRI

最近算畢業論文資料，然後要使用FSL，前幾天在昏昏沉沉的情況下不小心敲下 sudo rm -rf /usr/local Downsloads/fsl，然後整個人涼涼了，本來是想複製檔案的，結果悲劇了，我所有軟體都放在Local下，然後就沒了。。。
然後第二天花了2小時把常用的afni，freesurfer等等給重新安裝了，在安裝fsl的時候，出現了一點之前沒遇到過的問題，所以記錄一下，給大家也作個參考。
1、從fslinstaller.py安裝fsl，然後下載成功後，stage1花了我5小時，stage2等了1晚上還沒動靜，之前在這個電腦上安裝還挺順利的，這次不知道是為啥。感覺與python指令碼執行慢有很大的原因。然後我就關閉了後續的stage安裝。這是前提。

當我輸入 flirt -version 的時候，提示報錯，缺少依賴庫
懵了一下，後來網上搜，才知道新版fsl更新了依賴庫。哎，解決方法是安裝新庫sudo apt-get install libopenblas-dev，然後flirt -version就會正常出現了。

2、缺少lmglob檔案，這個我剛好有以前的fsl/bin/的函式備份，我就直接把imglob.py指令碼複製到/usr/local/fsl/bin/下了。

3、/usr/bin/env: ‘python’: no such file or directory
這個bug就有點坑爹了，我whereis python了一下，電腦裡有python2, python2.7, python3, python3.8，而且路徑都在usr/bin/下，不知道為啥要報錯，冥思苦想，網上找資料，才發現原來是fsl的bet腳本里把python的位置和名字給寫死了，所以就沒搜到，解決方法很簡單，作一個軟連線騙騙指令碼:

sudo ln -s /usr/bin/python2.7 /usr/bin/python

結束。