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“numba”一個可以讓你的Python飛起來編譯器

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本文章來自騰訊雲 作者:Python進階者

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python由於它動態解釋性語言的特性,跑起程式碼來相比java、c++要慢很多,尤其在做科學計算的時候,十億百億級別的運算,讓python的這種劣勢更加凸顯。

辦法永遠比困難多,numba就是解決python慢的一大利器,可以讓python的執行速度提升上百倍!

1 什麼是numba?

numba是一款可以將python函式編譯為機器程式碼的JIT編譯器,經過numba編譯的python程式碼(僅限陣列運算),其執行速度可以接近C或FORTRAN語言。

python之所以慢,是因為它是靠CPython編譯的,numba的作用是給python換一種編譯器。


python、c、numba三種編譯器速度對比

使用numba非常簡單,只需要將numba裝飾器應用到python函式中,無需改動原本的python程式碼,numba會自動完成剩餘的工作。

import numpy as np
import numba
from numba import
jit @jit(nopython=True) # jit,numba裝飾器中的一種 def go_fast(a): # 首次呼叫時,函式被編譯為機器程式碼 trace = 0 # 假設輸入變數是numpy陣列 for i in range(a.shape[0]): # Numba 擅長處理迴圈 trace += np.tanh(a[i, i]) return a + trace

以上程式碼是一個python函式,用以計算numpy陣列各個數值的雙曲正切值,我們使用了numba裝飾器,它將這個python函式編譯為等效的機器程式碼,可以大大減少執行時間。

2 numba適合科學計算

numpy是為面向numpy陣列的計算任務而設計的。

在面向陣列的計算任務中,資料並行性對於像GPU這樣的加速器是很自然的。Numba瞭解NumPy陣列型別,並使用它們生成高效的編譯程式碼,用於在GPU或多核CPU上執行。特殊裝飾器還可以建立函式,像numpy函式那樣在numpy陣列上廣播。

什麼情況下使用numba呢?

使用numpy陣列做大量科學計算時
使用for迴圈時
3 學習使用numba

第一步:匯入numpy、numba及其編譯器

import numpy as np
import numba 
from numba import jit

第二步:傳入numba裝飾器jit,編寫函式

# 傳入jit,numba裝飾器中的一種
@jit(nopython=True) 
def go_fast(a): # 首次呼叫時,函式被編譯為機器程式碼
    trace = 0
    # 假設輸入變數是numpy陣列
    for i in range(a.shape[0]):   # Numba 擅長處理迴圈
        trace += np.tanh(a[i, i])  # numba喜歡numpy函式
    return a + trace # numba喜歡numpy廣播

nopython =
True選項要求完全編譯該函式(以便完全刪除Python直譯器呼叫),否則會引發異常。這些異常通常表示函式中需要修改的位置,以實現優於Python的效能。強烈建議您始終使用nopython
= True。

第三步:給函式傳遞實參

# 因為函式要求傳入的引數是nunpy陣列
x = np.arange(100).reshape(10, 10) 
# 執行函式
go_fast(x)

第四步:經numba加速的函式執行時間

% timeit go_fast(x)

輸出:
3.63 µs ± 156 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100000 loops each)

第五步:不經numba加速的函式執行時間

def go_fast(a): # 首次呼叫時,函式被編譯為機器程式碼
    trace = 0
    # 假設輸入變數是numpy陣列
    for i in range(a.shape[0]):   # Numba 擅長處理迴圈
        trace += np.tanh(a[i, i])  # numba喜歡numpy函式
    return a + trace # numba喜歡numpy廣播

x = np.arange(100).reshape(10, 10) 
%timeit go_fast(x)

輸出:

136 µs ± 1.09 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10000 loops each)

結論:

在numba加速下,程式碼執行時間為3.63微秒/迴圈。不經過numba加速,程式碼執行時間為136微秒/迴圈,兩者相比,前者快了40倍。

4 numba讓python飛起來

前面已經對比了numba使用前後,python程式碼速度提升了40倍,但這還不是最快的。

這次,我們不使用numpy陣列,僅用for迴圈,看看nunba對for迴圈到底有多鍾愛!

# 不使用numba的情況
def t():
    x = 0
    for i in np.arange(5000):
        x += i
    return x
%timeit(t()) 

輸出:

408 µs ± 9.73 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
# 使用numba的情況
@jit(nopython=True) 
def t():
    x = 0
    for i in np.arange(5000):
        x += i
    return x
%timeit(t()) 

輸出:

1.57 µs ± 53.8 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000000 loops each)

使用numba前後分別是408微秒/迴圈、1.57微秒/迴圈,速度整整提升了200多倍!

5 結語

numba對python程式碼執行速度有巨大的提升,這極大的促進了大資料時代的python資料分析能力,對資料科學工作者來說,這真是一個lucky tool !

當然numba不會對numpy和for迴圈以外的python程式碼有很大幫助,你不要指望numba可以幫你加快從資料庫取數,這點它真的做不到哈。