1. 程式人生 > 程式設計 >.img/.hdr格式轉.nii格式的操作

.img/.hdr格式轉.nii格式的操作

MATLAB轉格式,需要使用spm package(https://github.com/neurodebian/spm12).

%%img2nii.m--------------------------------------------
%Script to convert hdr/img files to nii.
%This script uses SPM function,so you need to install SPM5 or later.
%Kiyotaka Nemoto 05-Nov-2014
 
%select files
f = spm_select(Inf,'img$','Select img files to be converted');
 
%convert img files to nii
for i=1:size(f,1)
 input = deblank(f(i,:));
 [pathstr,fname,ext] = fileparts(input);
 output = strcat(fname,'.nii');
 V=spm_vol(input);
 ima=spm_read_vols(V);
 V.fname=output;
 spm_write_vol(V,ima);
end

附加一下volume data是如何轉surface data的吧…

wb_command -volume-to-surface-mapping ArticParcels_Smithetal.nii /home/murphyhuang/tmp/nii/HCP_fMRI/Q1-Q6_R440.L.flat.32k_fs_LR.surf.gii outL.shape.gii -trilinear

補充知識:資料讀取——(.img .hdr)

1、定義

該影象格式含有兩部分:一個是影象 ‘.img ',另一個是影象標頭檔案 '.hdr',該檔案記錄了影象的資訊,如影象尺寸、波段數、資料型別和大小端等。如果缺少標頭檔案,將無法對影象進行讀取,因此標頭檔案十分重要。

2、讀取

使用Matlab中NifTi包讀取。

eg:

img=load_nii(‘D:\a01_101_bmask.hdr')

.img/.hdr格式轉.nii格式的操作

以上這篇.img/.hdr格式轉.nii格式的操作就是小編分享給大家的全部內容了,希望能給大家一個參考,也希望大家多多支援我們。