完美解決TensorFlow和Keras大資料量記憶體溢位的問題
記憶體溢位問題是參加kaggle比賽或者做大資料量實驗的第一個攔路虎。
以前做的練手小專案導致新手產生一個慣性思維——讀取訓練集圖片的時候把所有圖讀到記憶體中,然後分批訓練。
其實這是有問題的,很容易導致OOM。現在記憶體一般16G,而訓練集圖片通常是上萬張,而且RGB圖,還很大,VGG16的圖片一般是224x224x3,上萬張圖片,16G記憶體根本不夠用。這時候又會想起——設定batch,但是那個batch的輸入引數卻又是圖片,它只是把傳進去的圖片分批送到顯示卡,而我OOM的地方恰是那個“傳進去”的圖片,怎麼辦?
解決思路其實說來也簡單,打破思維定式就好了,不是把所有圖片讀到記憶體中,而是隻把所有圖片的路徑一次性讀到記憶體中。
大致的解決思路為:
將上萬張圖片的路徑一次性讀到記憶體中,自己實現一個分批讀取函式,在該函式中根據自己的記憶體情況設定讀取圖片,只把這一批圖片讀入記憶體中,然後交給模型,模型再對這一批圖片進行分批訓練,因為記憶體一般大於等於視訊記憶體,所以記憶體的批次大小和視訊記憶體的批次大小通常不相同。
下面程式碼分別介紹Tensorflow和Keras分批將資料讀到記憶體中的關鍵函式。Tensorflow對初學者不太友好,所以我個人現階段更習慣用它的高層API Keras來做相關專案,下面的TF實現是之前不會用Keras分批讀時候參考的一些列資料,在模型訓練上仍使用Keras,只有分批讀取用了TF的API。
Tensorlow
在input.py裡寫get_batch函式。
def get_batch(X_train,y_train,img_w,img_h,color_type,batch_size,capacity): ''' Args: X_train: train img path list y_train: train labels list img_w: image width img_h: image height batch_size: batch size capacity: the maximum elements in queue Returns: X_train_batch: 4D tensor [batch_size,width,height,chanel],\ dtype=tf.float32 y_train_batch: 1D tensor [batch_size],dtype=int32 ''' X_train = tf.cast(X_train,tf.string) y_train = tf.cast(y_train,tf.int32) # make an input queue input_queue = tf.train.slice_input_producer([X_train,y_train]) y_train = input_queue[1] X_train_contents = tf.read_file(input_queue[0]) X_train = tf.image.decode_jpeg(X_train_contents,channels=color_type) X_train = tf.image.resize_images(X_train,[img_h,img_w],tf.image.ResizeMethod.NEAREST_NEIGHBOR) X_train_batch,y_train_batch = tf.train.batch([X_train,y_train],batch_size=batch_size,num_threads=64,capacity=capacity) y_train_batch = tf.one_hot(y_train_batch,10) return X_train_batch,y_train_batch
在train.py檔案中訓練(下面不是純TF程式碼,model.fit是Keras的擬合,用純TF的替換就好了)。
X_train_batch,y_train_batch = inp.get_batch(X_train,train_batch_size,capacity) X_valid_batch,y_valid_batch = inp.get_batch(X_valid,y_valid,valid_batch_size,capacity) with tf.Session() as sess: coord = tf.train.Coordinator() threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord) try: for step in np.arange(max_step): if coord.should_stop() : break X_train,y_train = sess.run([X_train_batch,y_train_batch]) X_valid,y_valid = sess.run([X_valid_batch,y_valid_batch]) ckpt_path = 'log/weights-{val_loss:.4f}.hdf5' ckpt = tf.keras.callbacks.ModelCheckpoint(ckpt_path,monitor='val_loss',verbose=1,save_best_only=True,mode='min') model.fit(X_train,batch_size=64,epochs=50,validation_data=(X_valid,y_valid),callbacks=[ckpt]) del X_train,X_valid,y_valid except tf.errors.OutOfRangeError: print('done!') finally: coord.request_stop() coord.join(threads) sess.close()
Keras
keras文件中對fit、predict、evaluate這些函式都有一個generator,這個generator就是解決分批問題的。
關鍵函式:fit_generator
# 讀取圖片函式 def get_im_cv2(paths,img_rows,img_cols,color_type=1,normalize=True): ''' 引數: paths:要讀取的圖片路徑列表 img_rows:圖片行 img_cols:圖片列 color_type:圖片顏色通道 返回: imgs: 圖片陣列 ''' # Load as grayscale imgs = [] for path in paths: if color_type == 1: img = cv2.imread(path,0) elif color_type == 3: img = cv2.imread(path) # Reduce size resized = cv2.resize(img,(img_cols,img_rows)) if normalize: resized = resized.astype('float32') resized /= 127.5 resized -= 1. imgs.append(resized) return np.array(imgs).reshape(len(paths),color_type)
獲取批次函式,其實就是一個generator
def get_train_batch(X_train,is_argumentation): ''' 引數: X_train:所有圖片路徑列表 y_train: 所有圖片對應的標籤列表 batch_size:批次 img_w:圖片寬 img_h:圖片高 color_type:圖片型別 is_argumentation:是否需要資料增強 返回: 一個generator,x: 獲取的批次圖片 y: 獲取的圖片對應的標籤 ''' while 1: for i in range(0,len(X_train),batch_size): x = get_im_cv2(X_train[i:i+batch_size],color_type) y = y_train[i:i+batch_size] if is_argumentation: # 資料增強 x,y = img_augmentation(x,y) # 最重要的就是這個yield,它代表返回,返回以後迴圈還是會繼續,然後再返回。就比如有一個機器一直在作累加運算,但是會把每次累加中間結果告訴你一樣,直到把所有數加完 yield({'input': x},{'output': y})
訓練函式
result = model.fit_generator(generator=get_train_batch(X_train,True),steps_per_epoch=1351,validation_data=get_train_batch(X_valid,False),validation_steps=52,callbacks=[ckpt,early_stop],max_queue_size=capacity,workers=1)
就是這麼簡單。但是當初從0到1的過程很難熬,每天都沒有進展,沒有頭緒,急躁佔據了思維的大部,熬過了這個階段,就會一切順利,不是運氣,而是踩過的從0到1的每個腳印累積的靈感的爆發,從0到1的腳印越多,後面的路越順利。
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