prototype是建構函式的屬性，指向屬於該建構函式的原型物件

__proto__是任何物件的屬性，指向該物件的建構函式的原型物件

prototype和__proto__之間的唯一區別就在於前者是建構函式的屬性，而後者是物件的屬性。

關於prototype與__proto__容易讓人疑惑的點是，建構函式也有__proto__屬性。之所以會這樣，是因為建構函式也是一個物件，它是建構函式Function()的例項物件。因此，所有建構函式的__proto__屬性都指向Function建構函式的原型物件。
同時，原型物件是特殊的物件，每個建構函式的原型物件都會有一個__proto__屬性，共同指向建構函式Object()的原型物件。建構函式Object()的原型物件，作為除自身以外被所有原型物件指向的物件，其擔當著根節點的角色，它的__proto__屬性指向null。

對照著這個回答的高贊分享的圖應該能更好的理解我的回答，也就算是一個小筆記吧