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學習筆記253—fmri_2 dicom轉檔

還是bilibili課程筆記 https://b23.tv/FvgWGP
P6 dicom轉檔與pre
1 看原始資料
1)軟體 radiAnt
https://www.radiantviewer.com/c/how-to-install-radiant-dicom-viewer-on-macos/
這是軟體官網,裡面有一個安裝教程,跟著安裝順序下需要的軟體並安裝
注:這個軟體有個啟用license的介面,直接點next可以先用軟體,網上有教程說過期了重安
2)看資料,怎麼看,包括哪些內容
視訊講的很清楚 在p6 8min左右

2 資料轉換
目的:把source data 轉換成SPM可以分析的資料(analysis data)
這是第二步資料轉換了,上一個筆記裡已經有一步資料轉換了,將.IMA轉成.dcm,連結如下:
https://editor.csdn.net/md/?articleId=109509832
整體類似:raw data —— source data —— analysis data 【個人理解,敬請指正】
所需軟體 MRIConvert

(也有教用MRIcro這個軟體轉的,但是聽完感覺比MRIConvert 複雜,略,感興趣可以看p6 40min左右)
MRIConvert 軟體網址:按電腦系統下載安裝
https://lcni.uoregon.edu/downloads/mriconvert

直接點選.app 就能開啟,不用把.pkg拉到applications

   1、 軟體開啟後,視窗上半部分,選擇資料檔案(輸入),中間可以選擇轉成什麼格式,拉開如下,選擇 Analyze 7.5

2、 analysis 7.5 —— options (按需勾選)

3、選擇folder——選擇輸出路徑——convert all

資料轉換結果—— analysis format
每個資料夾含三類檔案
1、txt 是一些核磁相關的基礎資訊,寫文章可以用到,比如trial number,number of slices
2、.hdr和.img都是成對的,hdr是對應的img的一些引數資訊,往往比較小1k(必須要成對處理,比如刪都刪)
注:img和nifti兩種格式,都可以用於spm分析,只是轉換型別方式不一樣。
IMG的來源是用MRIconvert軟體裡選擇Analyze 7.5轉出來的
nifti的來源是用MRIconvert軟體裡選擇nifti轉出來的

參考連結:https://blog.csdn.net/weixin_44669441/article/details/109718580