pandas apply多執行緒實現程式碼
一、多執行緒化選擇
並行化一個程式碼有兩大選擇:multithread 和 multiprocess。
Multithread,多執行緒,同一個程序(process)可以開啟多個執行緒執行計算。每個執行緒代表了一個 CPU 核心,這麼多執行緒可以訪問同樣的記憶體地址(所謂共享記憶體),實現了執行緒之間的通訊,算是最簡單的並行模型。
Multiprocess,多程序,則相當於同時開啟多個 Python 直譯器,每個直譯器有自己獨有的資料,自然不會有資料衝突。
二、並行化思想
並行化的基本思路是把 dataframe 用 np.array_split 方法切割成多個子 dataframe。再呼叫 Pool.map 函式並行地執行。注意到順序執行的 pandas.DataFrame.apply 是如何轉化成 Pool.map 然後並行執行的。
Pool 物件是一組並行的程序,開源Pool類
開源Pool類定義
def Pool(self,processes=None,initializer=None,initargs=(),maxtasksperchild=None): '''Returns a process pool object''' from .pool import Pool return Pool(processes,initializer,initargs,maxtasksperchild,context=self.get_context())
設定程序初始化函式
def init_process(global_vars): global a a = global_vars
設定程序初始化函式
Pool(processes=8,initializer=init_process,initargs=(a,))
其中,指定產生 8 個程序,每個程序的初始化需執行 init_process函式,其引數為一個 singleton tuple a. 利用 init_process 和 initargs,我們可以方便的設定需要在程序間共享的全域性變數(這裡是 a)。
with 關鍵詞是 context manager,避免寫很繁瑣的處理開關程序的邏輯。
with Pool(processes=8,)) as pool: result_parts = pool.map(apply_f,df_parts)
三、多執行緒化應用
多執行緒時間比較和多執行緒的幾種apply應用
import numpy as np import pandas as pd import time from multiprocessing import Pool def f(row): #直接對某列進行操作 return sum(row)+a def f1_1(row): #對某一列進行操作,我這裡的columns=range(0,2),此處是對第0列進行操作 return row[0]**2 def f1_2(row1): #對某一列進行操作,我這裡的columns=range(0,2),此處是對第0列進行操作 return row1**2 def f2_1(row): #對某兩列進行操作,我這裡的columns=range(0,2),此處是對第0,2列進行操作 return pd.Series([row[0]**2,row[1]**2],index=['1_1','1_2']) def f2_2(row1,row2): #對某兩列進行操作,我這裡的columns=range(0,2),此處是對第0,2列進行操作 return pd.Series([row1**2,row2**2],index=['2_1','2_2']) def apply_f(df): return df.apply(f,axis=1) def apply_f1_1(df): return df.apply(f1_1,axis=1) def apply_f1_2(df): return df[0].apply(f1_2) def apply_f2_1(df): return df.apply(f2_1,axis=1) def apply_f2_2(df): return df.apply(lambda row :f2_2(row[0],row[1]),axis=1) def init_process(global_vars): global a a = global_vars def time_compare(): '''直接呼叫和多執行緒呼叫時間對比''' a = 2 np.random.seed(0) df = pd.DataFrame(np.random.rand(10**5,2),columns=range(0,2)) print(df.columns) t1= time.time() result_serial = df.apply(f,axis=1) t2 = time.time() print("Serial time =",t2-t1) print(result_serial.head()) df_parts=np.array_split(df,20) print(len(df_parts),type(df_parts[0])) with Pool(processes=8,)) as pool: #with Pool(processes=8) as pool: result_parts = pool.map(apply_f,df_parts) result_parallel= pd.concat(result_parts) t3 = time.time() print("Parallel time =",t3-t2) print(result_parallel.head()) def apply_fun(): '''多種apply函式的呼叫''' a = 2 np.random.seed(0) df = pd.DataFrame(np.random.rand(10**5,2)) print(df.columns) df_parts=np.array_split(df,)) as pool: #with Pool(processes=8) as pool: res_part0 = pool.map(apply_f,df_parts) res_part1 = pool.map(apply_f1_1,df_parts) res_part2 = pool.map(apply_f1_2,df_parts) res_part3 = pool.map(apply_f2_1,df_parts) res_part4 = pool.map(apply_f2_2,df_parts) res_parallel0 = pd.concat(res_part0) res_parallel1 = pd.concat(res_part1) res_parallel2 = pd.concat(res_part2) res_parallel3 = pd.concat(res_part3) res_parallel4 = pd.concat(res_part4) print("f:\n",res_parallel0.head()) print("f1:\n",res_parallel1.head()) print("f2:\n",res_parallel2.head()) print("f3:\n",res_parallel3.head()) print("f4:\n",res_parallel4.head()) df=pd.concat([df,res_parallel0],axis=1) df=pd.concat([df,res_parallel1],res_parallel2],res_parallel3],res_parallel4],axis=1) print(df.head()) if __name__ == '__main__': time_compare() apply_fun()
參考網址
https://blog.fangzhou.me/posts/20170702-python-parallelism/
https://docs.python.org/3.7/library/multiprocessing.html
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