阿里雲伺服器--Linux搭建blast本地版
阿新 • • 發佈:2020-09-02
環境
- 阿里雲ECS伺服器
- 系統:Ubuntu 20.04
下載blast程式碼
官網連結
https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
截圖如下
下載介面
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/
選擇LInux系統,如圖所示
右鍵->複製連結地址 獲得如下的地址
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.10.1+-x64-linux.tar.gz
實測在伺服器直接wget下載速度很慢,建議在本機用迅雷下載,然後用FTP傳輸工具傳到伺服器
如果使用FTP已經傳輸了,請跳過下面的步驟
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這裡我已經下載好了,因為MAC系統沒找到好的FTP工具,所以我使用SCP命令傳輸到伺服器
scp ncbi-blast-2.10.1+-x64-linux.tar.gz root@伺服器的ip地址:存放的目錄 例如 scp ncbi-blast-2.10.1+-x64-linux.tar.gz [email protected]:/root/
使用XSEHLL等遠端工具連線伺服器,在終端輸入以下命令
cd /切換到剛剛傳輸的路徑 例如 cd /root # 解壓檔案 tar -zxvf ncbi-blast-2.10.1+-x64-linux.tar.gz # 重新命名壓縮檔案為blast mv ncbi-blast-2.10.1+ blast # 配置環境變數 echo "PATH=$PATH:~/剛剛傳輸的路徑/blast/bin" >> ~/.bashrc 例如 echo "PATH=$PATH:~/root/blast/bin" >> ~/.bashrc # source source ~/.bashrc # 檢測是否安裝成功 blastn -h # 輸出的結果如下圖
至此blast服務安裝成功。
注:本部落格基於官網文件和B站UP主的視訊完成 XiongdyMishika
在此也對UP主:XiongdyMishika 感謝!