高通量測序中,reads、contigs、scaffold之間的聯系
read:測序時,產生的較短的原始序列叫read
contigs:有多個reads通過片段的重疊,組裝成一個更大的read,稱為contigs
scaffold:多個contigs通過片段的重疊拼接成更長的scaffold;
從上面的解釋來看,可以發現這些命名應該比價常出現在de novo拼接當中。
一個contigs組裝之後,鑒定發現是編碼蛋白的基因,就叫做singleton
scaffold,經鑒定發現它是編碼蛋白的基因,就叫做unigene
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