TCGA三個在線可視化網站
1.>c-Bioportal: www.cbioportal.org
整合和簡化了包括TCGA,ICGC以及GEO等多個癌癥基因組數據庫的內容,提供友好可視化的界面,可供下載。
主要展示基因的somatic 突變譜,拷貝數變化,mRNA&miRNA表達量變化,DNA甲基化以及蛋白質表達的情況,並結合患者的臨床資料,展示了KM生存曲線。
2.>OncoLnc: www.oncolnc.org
這是一個整合了TCGA的各種RNA數據和患者臨床數據,提供生存分析的網站,灰常簡單好用。
3.>MEXPRESS:mexpress.be/about
整合了TCGA中的DNA甲基化,表達量及臨床數據,主要用來探索甲基化,基因表達和臨床表型之間的關聯,看界面也很友好
TCGA三個在線可視化網站
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