system() 輸出並返回最後一行shell結果。
exec() 不輸出結果，返回最後一行shell結果，所有結果可以保存到一個返回的數組裏面。
passthru() 只調用命令，把命令的運行結果原樣地直接輸出到標準輸出設備上。

eg:

<?php
echo "\nsystem";
$last_line = system(‘ls‘, $return_var);
echo "\nreturn_var:";
print_r($return_var);
echo "\nlast_line:";
print_r($last_line);

echo "\n\nexec";
exec(‘ls
 
‘, $output, $return_var);
echo "\nreturn_var:";
print_r($return_var);
echo "\noutput:";
print_r($output);

echo "\n\nshell_exec";
$output = shell_exec(‘ls‘);
echo "\noutput:";
print_r($output);
?>

system()，exec() ，passthru()