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在之前的文章中，介紹過igraph工具，可以通過程式設計處理網路資料，該工具使用與大規模，大批量資料的處理。如果只是偶爾需要分析下網路資料，採用cytoscape這種圖形介面工具更加的簡單便捷。

cytoscape相信很多人都用過，通常都是用來進行網路的視覺化，對於分析網路的基本拓撲屬性，比如計算clustering coefficient值等，在cytoscape中也可以方便的得到。

在cytoscape3.0版本以後，集成了NetworkAnalyzer工具，這個工具可以方便的計算常用的拓撲屬性。通過Tools->NetworkAnalyzer可以開啟該工具，分析的結果會在右側的結果面板顯示，常用的結果展示如下

1. Simple Parameter

會給出網路的clustering coefficient，density等值，示意如下

2. Node Degree Distribution

對於一個scale-free network 而言，節點的度數分佈符合冪律分佈，該部分可以估計出對應的係數

3. Shorest Path Length Distribution

由於真實網路的small-world effect效用，network中的最短路徑的值都非常小，從下圖也可以看出，最大為7

4. Betweenness Centrality

5. Closeness Centrality

除此之外，還有很多圖論中專屬的描述網路的一些特徵和屬性，就不一一展示了。通過NetworkAnalyzer工具， 可以快速得到常見的network基本屬性。

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