/bin： 包含了引導啟動所需的命令或普通使用者可能用的命令(可能在引導啟動後)。這些命令都是二進位制檔案的可執行程式，多是系統中重要的系統檔案。

/boot： 包含可引導的Linux核心和引導裝載（boot loader）配置檔案（GRUB）。

/dev： 包含代表系統裝置訪問點的檔案。這包括終端裝置（tty*)、軟盤（fd*）、硬碟（hd*）、RAM（ram*）和CD-ROM（cd*）（使用者通常通過裝置檔案直接訪問這些裝置）。

/home： 包含分配給每個擁有登陸帳號使用者的目錄。

/media：提供掛載（mounting）和自動掛載裝置的標準位置，如遠端檔案系統和可移動介質（目錄名為cdrecorder、floppy等）。

/mnt： 在被標準的/media目錄替代前，這是很多裝置常用的掛載點。某些可引導的Linux系統仍舊使用該目錄來掛載硬碟分割槽和遠端檔案系統。

/root：表示根使用者的主目錄。

/sbin：也用於儲存二進位制檔案。因為其中的大部分檔案多是系統管理員使用的基本的系統程式，所以雖然普通使用者必要且允許時可以使用，但一般不給普通使用者使用。

/sys：一個類似與/proc的檔案系統，在Linux2.6核心中最新出現的，包含的檔案用於獲得硬體狀態並反映核心看到的系統裝置樹。它使用了/proc中的很多幫助。

/tmp：包含應用程式使用的臨時檔案。

/lib ：該目錄用來存放系統動態連結共享庫，幾乎所有的應用程式都會用到該目錄下的共享庫。（64位還包括 lib64）

/lib/modules ：包含系統核心可載入各種模組，尤其是那些在恢復損壞的系統時重新引導系統所需的模組(例如網路和檔案系統驅動)。

/lost＋found 該目錄在大多數情況下都是空的。但當突然停電、或者非正常關機後，有些檔案就臨時存放在這裡。

/usr：包含使用者文件、遊戲、圖形檔案（X11）、庫（lib），以及各種其他使用者和管理命令及檔案。

/var：包含不同應用程式使用的資料目錄。特別要注意的是，這裡放置作為FTP伺服器（/var/ftp）成Web伺服器（/var/www）共享檔案。它還包含所有系統日誌檔案（/var/log）。

/etc：包含管理配置檔案。該目錄存放系統管理時要用到的各種配置檔案和子目錄，例如網路配置檔案、檔案系統、X系統配置檔案、裝置配置資訊、設定使用者資訊等。

/proc：包含有關係統資源的資訊。可以在該目錄下獲取系統資訊，這些資訊是在記憶體中由系統自己產生的，該目錄的內容不在硬碟上而在記憶體裡。