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基於GDAL庫,讀取.nc檔案(以海洋表溫資料為例)

  對於做海洋資料處理的同學,會經常遇到nc格式的檔案,nc檔案的格式全稱是NetCDF,具體的詳細解釋請查詢官網【https://www.unidata.ucar.edu/software/netcdf/docs/index.html】,一般從全球大洋資料庫裡面下載的溫鹽、風場及雲量等資料,基本上是nc檔案格式,每一個檔案裡面包含多個數據集,例如最簡單的海面表溫資料(Sea surface temperature data),資料範圍是全球,空間解析度為0.25 *0.25(~25km),時間解析度為3 hour,所以一天的觀測資料裡面包含著兩個子資料集(subDataset),一是海洋表溫資料集,另一個是遺失資料說明資訊資料集,在第一個子資料集(海洋表溫資料集)內,又會包含分層資料,也就是每隔3個小時時間解析度下的表溫資料。

  基於前期查詢李民錄老師的《GDAL原始碼剖析與開發指南》一書才瞭解到,GDAL庫本身是支援上述檔案的讀取的,故編譯GDAL庫(2.3.2版本),編譯器採用MSVC2017版本,開發平臺採用QT 5.11.2版本,由於QT本身不具有MSVC編譯器配套的偵錯程式,所以去微軟官網下載了相應的偵錯程式(winsdksetup.exe,安裝的時候只選擇安裝Debugging Tools for Windows即可);經過查詢GDAL官網的資料,GDAL庫如若進行nc檔案的讀取和建立,必須還要單獨下載NetCDF庫檔案,安裝好後,配置環境變數即可,編譯GDAL庫時,設定好opt檔案,開始編譯,編譯成功後即可通過下述參考部落格1(Qt配置GDAL)方法,配置GDAL庫。

  配置完成以後,即可進行檔案的讀取工作,話不多說,獻上程式碼

讀取-標頭檔案

 1 #ifndef NCFILEREAD_H
 2 #define NCFILEREAD_H
 3 
 4 
 5 class ncFileRead
 6 {
 7 public:
 8     void ncFileRead::fileRead(const char *ncFileName);
 9 };
10 
11 #endif // NCFILEREAD_H

讀取-原始檔

  1 #include "ncfileread.h"
  2 
  3 #include <gdal_priv.h>
  4
#include <vector> 5 #include <QVector> 6 #include <string> 7 #include <QString> 8 #include <QStringList> 9 #include <QDebug> 10 11 using namespace std; 12 13 void ncFileRead::fileRead(const char *ncFileName) 14 { 15 vector <string> vFileSets; 16 vector <string> pStrDesc; 17 vector<vector<float>> allSSTPixelNum; 18 19 GDALAllRegister(); 20 CPLSetConfigOption("GDAL_FILENAME_IS_UTF8","NO");//中文路徑 21 GDALDataset* fileDataset = (GDALDataset*) GDALOpen(ncFileName,GA_ReadOnly);//開啟HDF資料集 22 if (fileDataset == NULL) 23 { 24 return; 25 } 26 27 char** sublist = GDALGetMetadata((GDALDatasetH) fileDataset,"SUBDATASETS");//獲得資料的字串,可以打印出來看看自己需要的資料在那 28 29 int iCount = CSLCount(sublist); 30 if(iCount <= 0){ 31 qDebug() << "該檔案沒有子資料" << endl; 32 GDALClose((GDALDriverH)fileDataset); 33 } 34 35 //儲存資料集資訊 36 for(int i = 0; sublist[i] != NULL;i++){ 37 38 qDebug() << sublist[i] << endl; 39 40 if(i%2 != 0){ 41 continue; 42 } 43 44 /** 45 * 01、海洋表溫度資料集 float32 46 * 02、資料丟失補充資訊 int8 47 * */ 48 string tmpstr = sublist[i]; 49 tmpstr = tmpstr.substr(tmpstr.find_first_of("=")+1); 50 const char *tmpc_str = tmpstr.c_str(); 51 52 string tmpdsc = sublist[i+1]; 53 tmpdsc = tmpdsc.substr(tmpdsc.find_first_of("=")+1); 54 55 GDALDataset* hTmpDt = (GDALDataset*)GDALOpen(tmpc_str,GA_ReadOnly);//開啟該資料 56 57 if (hTmpDt != NULL) 58 { 59 vFileSets.push_back(tmpc_str); 60 } 61 if(&pStrDesc != NULL){ 62 pStrDesc.push_back(tmpdsc); 63 } 64 GDALClose(hTmpDt); 65 } 66 67 68 //資料處理 69 70 qDebug() << "read RasterBand(1) ......" << endl; 71 72 //讀取第一個波段 73 74 QString qtmpdsc = QString::fromStdString(pStrDesc[0]); 75 QStringList qtmpdsclist = qtmpdsc.split(" "); 76 QString dataset_name = qtmpdsclist[1]; 77 78 float *lineData = NULL; 79 if (dataset_name == "sea_surface_temperature") 80 { 81 GDALDataset *tempDt = (GDALDataset *)GDALOpen(vFileSets[0].data(), GA_ReadOnly); 82 int BandNum = tempDt->GetRasterCount(); 83 84 GDALRasterBand * poBand = tempDt->GetRasterBand(1); 85 lineData = new float[1 * poBand->GetXSize()]; 86 for (int iLine = 0; iLine < poBand->GetYSize(); iLine++) 87 { 88 allSSTPixelNum.resize(poBand->GetYSize()); 89 for (int iPixel = 0; iPixel < poBand->GetXSize(); iPixel++) 90 { 91 allSSTPixelNum[iLine].resize(poBand->GetXSize()); 92 poBand->RasterIO(GF_Read, 0, iLine, poBand->GetXSize(), 1,lineData, poBand->GetXSize(), 1, GDT_Float32, 0, 0); 93 allSSTPixelNum[iLine][iPixel] = lineData[iPixel]; 94 } 95 } 96 if (lineData) 97 { 98 delete[]lineData; 99 lineData = NULL; 100 } 101 GDALClose((GDALDatasetH)tempDt); 102 } 103 104 105 qDebug() << "read complete!" << endl; 106 107 GDALClose((GDALDriverH)fileDataset); 108 109 }

主函式呼叫

 1 #include <QCoreApplication>
 2 
 3 #include "ncfileread.h"
 4 #include <QWidget>
 5 
 6 int main(int argc, char *argv[])
 7 {
 8     QCoreApplication a(argc, argv);
 9 
10     ncFileRead nfr;
11     nfr.fileRead("F:/Data File/test/SEAFLUX-OSB-CDR_V02R00_SST_D20060101_C20160824.nc");
12 
13     return a.exec();
14 }

 檔案讀取結果

  至此,nc檔案的讀取工作已經完成,資料讀取上來以後,即可進行進一步的資料處理工作。

致謝

  感謝李民錄老師的指導,以及其他不知姓名的的博主,再次感謝你們對於技術的分享!

參考部落格

1、Qt配置GDAL【https://blog.csdn.net/u010670734/article/details/53106786?locationNum=13&fps=1】

2、使用GDAL讀取necdf資料【https://blog.csdn.net/bluels01/article/details/8091260】

3、使用GDAL獲取HDF等資料集中的影象【https://blog.csdn.net/liminlu0314/article/details/8478339】