首先，這兩種考試從本質上來講，是有區別的。

軟考主管單位：人事部和信產部
一般的常識來講,由人事部主管的考試,基本上都跟職稱有或多或少的關係。
軟考在2004年以前，分為資格考試和水平考試，資格考試與職稱掛鉤。2004年以後，資格、水平合併，軟考全面實施“以考代評”，通過相應級別考試，可以獲聘對應職稱（助理工程師、工程師、高階工程師）。
等考主管單位：教育部
等考僅僅是計算機基本應用或某一方面技術應用水平的考核，通過考試僅能證明考生的水平到達了一定標準。由於是教育部直屬考試，所以很多學校將畢業證與等考相應級別掛鉤（大專、高職、本科非計算機專業）。等考基本上與從業資格無關，但是國家公務員、軍隊等特殊崗位有的將等考列為基本技能的考核之一。

其次，參考人群不同。

軟考主要是面向計算機專業學生、IT從業人員、有評職稱需求的在職人員；
等考主要是面向大專、高職、本科非計算機專業學生、公務員，但是三級以上以計算機專業學生為主。
也就是說，軟考基本上面對的都是專業人員，而等考大多數參考人員為非專業人員或專業水平相對較低的人員。

最後一點，軟考的難度遠遠大於等考