clusterProfiler安裝或者升級中出現的版本問題
1、之前按照官網的流程,如下,安裝了該包並載入DOSE之後一直提示裝不上enrich plot:
## try http:// if https:// URLs are not supported source("https://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("clusterProfiler")
2、
3、該問題的意思是R 3.4.3版本的不能裝enrichplot,但是官方手冊又說只要R版本>=3.4.0就ok。
4、於是我通過GitHub的方法裝上了enrichplot,此時要注意的是,DOSE也同時升級了,如果你強行載入clusterProfiler的話,就會出現各種版本不相容的提示,大致如下:
5、此時問題的解決方案就是,首先保證enrichplot以及DOSE都是通過GitHub方式裝的,然後載入他們,最後再通過github的方式(devtools::install_github('GuangchuangYu/clusterProfiler'))裝上clusterProfiler。搞定!
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