如何使用robex處理MRI大腦圖片+後續工作疑問
阿新 • • 發佈：2019-01-07
.在昨天到今天下午，一直很煩惱如何去使用robex對MRI照片進行處理（剝離腦殼），剛剛終於知道應該如何處理。
檢視nii檔案的Matlab程式碼為nii = load_nii(‘檔案’); view_nii(nii)。
使用robex對的步驟如下：
- 將資料資料夾中的T1照片（.dcm格式）成組地轉化為一個nii檔案，即把一組二維的T1照片轉變為三維的照片
首先在Help->preferences中設定中輸出等設定，
然後選擇File->DICOM2NIfTI，選中要轉化的一個病人的一組T1的slice（二維切面），生成了一個在slice檔案（.dcm字尾）目錄下的nii檔案。
- 然後使用robex生成剝離腦殼的經處理nii檔案（並不是用matlab使用reslice_nii命令處理後的nii檔案，而是直接由mricron軟體即步驟1產生的nii檔案。步驟1生成的檔案無法使用matlab展示，需使用resilce_nii(‘old_file_position’,’new_file_position’)處理後生成的檔案檢視）。
命令是runROBEX.bat inputFile strippedFile [outputMaskFile] [seed] 引數1是DICOM2NIfTI處理後的三維檔案，引數2是自己命名的輸出檔案（命令輸入前可不存在）
剩餘問題：
1. 如何批量將成組T1 slice（即多個病人的T1 slice）轉化成nii的三維檔案
2. 如何用原始的照片減去robex剝離腦殼的照片得到腦殼。
3. 使用unex、vnex及這兩種網路的變種訓練資料。