本文主要內容來自百度知道，我只是略做修改；

總的來說不透明度調節的是整個圖層的不透明度, 注意是整個圖層的，而填充是隻是改變填充部分的不透明度。

調整不透明度會影響整個圖層中多有的物件（原圖層中的物件和新增的各種圖層樣式效果），而修改填充時只會影響原影象，不會影響新增效果（新增的圖層樣式）。

 1、通過與不少朋友的討論，關於這兩者的區別，大多數朋友只是意識到二者在圖層效果上的不同。那就是層不透明度對圖層中的畫素及其效果都產生影響，而填充不透明度則只對圖層中的畫素產生影響，對圖層效果則毫無影響。我要告訴大家的是，這只是二者最基本的區別，但二者的區別絕不僅僅如此。

2、有一位朋友通過試驗發現了二者在溶解模式下的不同表現，這是非常難能可貴的，因為他通過一個洞窺到了這兩個不透明度在另一種情形下的不同----那就是在混合模式中的不同表現。具體地講，二者的不同表現只存在於顏色加深（減淡）、線性加深（減淡）、亮光、線性光、差值、實色混合、溶解等9種具有色階溢位的混合模式中。這些不同大家可以通過簡單的試驗一一予以驗證。

3、二者之不同還表現在一個平常不為人注意的角落----那就是高階混合選項中的“挖空”。“挖空”選項的探討屬PS中頂級難題了。但層不透明度和填充不透明度在挖空中的不同表現是顯而易見的。那就是層不透明度控制挖空的程度，即控制挖空層和目標層之間所有圖層被穿透的程度；而填充不透明度只是影響挖空層和目標層的混合程度。

如果我們對層不透明度和填充不透明度的區別停留於上面的歸納，那仍然是不夠的。

我們不妨以混合模式中的混合色為例，再來簡單說明一下二者在混合模式中對混合結果的影響方式：層不透明度直接影響的是混合的結果色，混合色不透明度逐步減小的過程，是混合的結果色逐漸向基色逼近的過程；而填充不透明度逐漸減小的過程，則是混合色逐漸向相應混合模式的中性色逼近的過程。

簡而言之，層不透明度直接影響的是結果色，而填充不透明度直接影響的則是混合色本身。相當於一個加法算式A+B=C，層不透明度直接影響的是C，而填充不透明度則直接影響的是其中的一個加數B，通過影響加數B間接地影響和C。

聯想一下二者在圖層樣式以及挖空選項的中區別，我們自然而然地應該受到這樣的啟迪： PS中的層不透明度為“總”，填充不透明度則為“分”，前者控制整體，而二者則控制區域性。這就是層不透明度和填充不透明度在深層次上的區別，也體現出PS程式設計中的一個基本思想。