對於撰寫高效MATLAB程式碼，一些建議：
雖然for-loop的速度有了很大改善，vectorization（向量化）仍舊是改善效率的重要途徑，尤其是在能把運算改寫成矩陣乘法的情況下，改善尤為顯著。
在不少情況下，for-loop本身已經不構成太大問題，尤其是當迴圈體本身需要較多的計算的時候。這個時候，改善概率的關鍵在於改善迴圈體本身而不是去掉for-loop。
MATLAB的函式呼叫過程（非built-in function）有顯著開銷，因此，在效率要求較高的程式碼中，應該儘可能採用扁平的呼叫結構，也就是在保持程式碼清晰和可維護的情況下，儘量直接寫表示式和利用built-in function，避免不必要的自定義函式呼叫過程。在次數很多的迴圈體內（包括在cellfun, arrayfun等實際上蘊含迴圈的函式）形成長呼叫鏈，會帶來很大的開銷。
在呼叫函式時，首選built-in function，然後是普通的m-file函式，然後才是function handle或者anonymous function。在使用function handle或者anonymous function作為引數傳遞時，如果該函式被呼叫多次，最好先用一個變數接住，再傳入該變數。這樣，可以有效避免重複的解析過程。
在可能的情況下，使用numeric array或者struct array，它們的效率大幅度高於cell array（幾十倍甚至更多）。對於struct，儘可能使用普通的域（欄位，field）訪問方式，在非效率關鍵，執行次數較少，而靈活性要求較高的程式碼中，可以考慮使用動態名稱的域訪問。
雖然object-oriented從軟體工程的角度更為優勝，而且object的使用很多時候很方便，但是MATLAB目前對於OO的實現效率很低，在效率關鍵的程式碼中應該慎用objects。
如果需要設計類，應該儘可能採用普通的property，而避免靈活但是效率很低的dependent property。如非確實必要，避免過載subsref和subsasgn函式，因為這會全面接管對於object的介面呼叫，往往會帶來非常巨大的開銷（成千上萬倍的減慢），甚至使得本來幾乎不是問題的程式碼成為效能瓶頸。