1. 程式人生 > >Пример использования: лаборатория Гутмана 

Пример использования: лаборатория Гутмана 

Благодаря использованию AWS лаборатория Гутмана теперь располагает эластичными вычислительными ресурсами, которые обеспечивают эффективную работу при изменении требований. «Нам не пришлось создавать собственный физический кластер для циклически меняющихся нагрузок на вычислительные ресурсы, ведь AWS выполняет масштабирование автоматически», – говорит Лилли. «Теперь нет необходимости тратить время на определение приоритетности проектов. Можно не беспокоиться о том, что вычислительных мощностей не хватит и придется обновлять оборудование каждые несколько лет, – добавляет Гутман. –  AWS также позволяет активно разрабатывать и тестировать новые методы исследования. Эта платформа определенно стала решающим инструментом в нашей лаборатории».

Лаборатория теперь располагает необходимой гибкостью для простого добавления вычислительных ресурсов по мере необходимости. «Недавно мы расширили лабораторную систему GlusterFS с 5 до 24 терабайт, и для этого не пришлось приобретать новое оборудование, – сообщает Лилли. –  Мы просто добавили узлы Amazon EC2 и увеличили емкость облачного хранилища, на это хватило одного часа. Раньше на это пришлось бы потратить несколько недель, поскольку требовалось бы предварительное обсуждение цен, а затем приобретение, установка и тестирование оборудования».

Кроме того, использование облака AWS существенно ускоряет анализ данных больших незакодированных генов РНК. «Для анализа больших незакодированных генов РНК требуются мощные средства вычислительной обработки и интеграции данных, – поясняет Гутман. –  Благодаря AWS стало возможно быстрое выполнение вычислений с помощью 1000 и более вычислительных узлов. Теперь анализ геномного секвенирования занимает несколько дней, а не недель, как прежде. Это было бы невозможно сделать с ограниченными ресурсами, которыми мы располагали ранее».

Лаборатория также смогла сократить расходы за счет использования спотовых инстансов Amazon EC2, которые предлагают неиспользуемые вычислительные мощности Amazon EC2 со скидкой до 90 % по сравнению с ценами на инстансы по требованию. «С учетом эластичных вычислительных возможностей, предоставляемых AWS, а также экономичности спотовых инстансов EC2, этот кластер оказался гораздо дешевле любого из возможных решений, которые мы могли обеспечить сами», – утверждает Гутман.

Сервисы Amazon WorkSpaces и Simple AD обеспечивают лаборатории Гутмана простое управление доступом в кластере HPC. «Когда мы только начали работать с кластером, синхронизация данных для доступа между рабочим столом Linux, управляющими компьютерами и CfnCluster казалась непростой задачей, – вспоминает Лилли. –  Интегрировав в кластер Simple AD, мы сэкономили немало времени, поскольку теперь можем централизованно активировать и отключать аккаунты пользователей из одного места. Сервис Simple AD обеспечивает единообразие авторизации по всей рабочей среде».

В конечном счете Калифорнийский технологический институт планирует перевести на платформу AWS и другие лаборатории и отделы. «Мы предоставляем нашу систему на платформе AWS другим исследователям генома, – говорит Лилли. –  Ее можно использовать как шаблон, успешно применимый при выполнении любых высокопроизводительных вычислений в нашем институте».

相關推薦

Пример использования: лаборатория Гутмана 

Благодаря использованию AWS лаборатория Гутмана теперь располагает эластичными вычислительными ресурсами, которые обеспечивают эффективную рабо

Пример использования: Гарвардская медицинская школа 

Лаборатория Тонеллато занимается вопросами персонализированной медицины – профилактических медицинских услуг на основании индивидуальных генети

Пример использования AWS: Remind

Amazon Web Services приглашает на работу. Amazon Web Services (AWS) – динамично растущее подразделение в составе Amazon.com. В настоящее в

Пример использования: Европол 

Amazon Web Services приглашает на работу. Amazon Web Services (AWS) – динамично растущее подразделение в составе Amazon.com. В настоящее в

Foursquare: пример использования 

Foursquare уже имела опыт использования Amazon Web Services (AWS) для хранения данных и тестирования и убедилась в том, что облако AWS может по

Примеры использования и истории успеха клиентов 

Лаборатория Гутмана в Калифорнийском технологическом институте использует кластер высокопроизводительных вычислений (HPC) на базе AWS

AWS для разработчиков. Типовые сценарии использования AWS

Андрей Зайчиков, Архитектор AWS Всем привет! Этим постом мы открываем серию публикаций по использованию Amazon Web Services для со

Примеры использования AWS: The Seattle Times

Для решения основной проблемы с масштабируемостью техническая группа Seattle Times рассмотрела несколько альтернативных вариантов хостинга, вкл

Начало работы с примерами использования Amazon Web Services (AWS)

Amazon Web Services приглашает на работу. Amazon Web Services (AWS) – динамично растущее подразделение в составе Amazon.com. В настоящее в

Примеры использования AWS: Localytics

Amazon Web Services приглашает на работу. Amazon Web Services (AWS) – динамично растущее подразделение в составе Amazon.com. В настоящее в

Примеры использования AWS: Hess Corporation

Чтобы подготовить инфраструктуру к переносу на платформу AWS, Hess и Nimbo разработали параллельный подход к проблеме с двух сторон: