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轉錄組(未完待續)

差異表達基因熱圖:

分析軟體:R、heatmap.2

差異基因熱圖分析,又稱差異基因聚類分析,用於判斷不同實驗條件下調控模式的聚類模式,比較不同實驗組合之間RPKM的差異。以不同的實驗條件之間的差異基因的RPKM作為輸入,用層次聚類(hierarchicalclustering)或者K均值(K-means)等方法對不同表達調控模式進行分類,不同的顏色的區域代表不同的聚類分組資訊,同組內的基因表達調控模式類似,可能參與到相同的生物學過程中。由於通常情況下,差異表達基因較多,導致畫出熱圖無法標出基因名字,因此建議用客戶感興趣差異基因進行熱圖分析。

T_case_W_ctrl_1958_Significant_heatmap

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