linux下python匯入xgboost出現的問題小結
在python匯入import xgboost出現如下錯誤:
./lib/libgomp.so.1: version `GOMP_4.0' not found (required by /home/yin/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/xgboost-0.6-py3.5.egg/xgboost/libxgboost.so)
上面顯示的意思是在$PYTHON_HOME/lib/libgomp.so.1中沒有‘GOMP_4.0',這個可以使用strings命令檢視libgomp.so.1這個檔案,顯示如下只有到_3.0版本
因為$PYTHON_HOME/lib/libgomp.so.1是一個連結檔案,所以使用locate命令搜系統中所有的libgomp.so.1,顯示的結果GOMP_1.0 GOMP_2.0 GOMP_3.0 GOMP_CPU_AFFINITY
/usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.8/libgomp.so
/usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/5/libgomp.so
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgomp.so.1
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgomp.so.1.0.0
可以使用strings命令檢視上面結果哪一個檔案包含GOMP_4.0,在本機中/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgomp.so.1包含了該字串(說明它包含GOMP_4.0)
下面刪掉舊的$PYTHON_HOME/lib/libgomp.so.1,重新做一個新的連結
ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgomp.so.1 libgomp.so.1
在pyton中測試import xgboost,又出現了下面的問題,使用相同的方法,替換掉python下對應的連結檔案libstdc++.so.6即可
scipy libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.21'
最終替換掉2個檔案後,在python可正常匯入xgboost...O(∩_∩)O~~
問題剖析:
因為之前的xgboots是使用gcc5.0編譯的,而python2.7依賴於gcc4.7。在python中低版本呼叫了高版本的gcc庫檔案,從而導致了這個錯誤。
參考:
https://github.com/dmlc/xgboost/issues/1786
https://xgboost.readthedocs.io/en/latest/build.html
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