可變剪下是一個過程，及主要基因或者mRNA前體轉錄所產生的RNA的外顯子以多種方式通過RNA剪下進行重連，由此產生的不同的基因可能被翻譯成不同的蛋白質構體，因此，一個基因可能編碼多種蛋白質。

  可變剪下與蛋白質組多樣性

人體基因組可能有約35000個基因，果蠅約14000個基因，而簡單的生物線蟲約19000個基因，生物的複雜性與其基因組基因數量似乎存在明顯差異。原因在蛋白質組，基因重排，RNA編輯，和可變剪接等機制可以從一個基因產生多種蛋白，從而使蛋白質組中蛋白質的數量超過基因組中基因的數量，其中，從影響的基因數量和生物種類來看，可變剪接是擴大蛋白質多樣性的最重要的機制。

  單個基因可變剪接的多樣性

一個基因可以通過如下幾種方式產生多個轉錄體，如不同的轉錄起始位點，可變剪接，選擇不同的加尾訊號位點，RNA編輯等，可變剪接包括3種類型：1.內含子的保留;2.可變外顯子的保留或切除；3.3'和5'剪接位點的轉移導致外顯子的增長或縮短。可變剪接對蛋白質結構的影響也是多樣性的，如多肽鏈中一個到數百個氨基酸

的增加或減少：某功能域的有無;如果可變剪接使讀碼框架改變，則可能無法有效翻譯，mRNA被監視系統降解。

  可變剪接背景知識

內含子剪接訊號

內含子剪接需要區分外顯子及內含子，識別訊號主要包括內含子5’及3'末端序列及中間分支點附近的序列。內含子5'剪接點稱為供體點，3'剪接點稱為受體點。內含子開始和末端的兩隊鹼基最為保守。

剪接過程，U1結合donor site,U2結合branch site,U4,U5,U6連結U1，U2

可變剪接的主要模式

  可變剪接的結果

由於採用不同的外顯子，導致編碼蛋白質的不同，有時會出現蛋白提前終止，起到分子開關的作用。

可變剪接的調控：

主要的順式作用元件有：

ESE:exon  splicing   enhancer   外顯子剪接增強子

ISE: intron  splicing  enhancer    內含子剪接增強子

ESS:exon   splicing  silencer   外顯子剪接沉默子

ISS:intron splicing silencer 內含子剪接沉默子