邏輯上所有的目錄只有一個頂點（根目錄）”/”,它是所有目錄的起點。

根下是一個有層次的樹形目錄結構。在shell中通過tree命令可以檢視該結構。

在linux系統中，目錄結構和磁碟分割槽在邏輯上沒有必然的聯絡，即不同的目錄可以跨越不同的磁碟裝置或分割槽。在實際應用中，必須通過一個分割槽入口才能向磁碟中寫入資料，該“入口”就是“掛載點”。要實現掛載，可以採用mount命令。例如：

#mount /dev/sdb1 /usr

就表示將/usr目錄掛載到硬碟分割槽/dev/sdb1。

Linux的目錄結構也是有一定規律的，且是按照類別組織的，隨著裝置的發展，硬碟的容量越來越大，各個目錄的含義進一步得到了明確，例如：

/bin——所有使用者存放常用二進位制命令

/boot——linux核心及引導系統程式所需的檔案目錄

/dev——裝置檔案的目錄，如音效卡、磁碟、光碟機等

/etc——存放系統配置檔案

/home——普通使用者的家目錄，預設存放普通使用者的資料

/lib——庫檔案存放目錄

/lost+found——存放系統意外崩潰或意外關機時產生的檔案碎片

/mnt——臨時掛載儲存裝置的掛載目錄，如U盤、光碟機等

/opt——有些軟體包可能會被安裝到這裡，即自定義軟體包，視習慣或規範而定

/proc——核心及程序資訊的虛擬檔案系統

/sbin——大多是涉及系統管理的命令的存放，該目錄和/usr/sbin、/usr/local/sbin目錄相似

/temp——存放臨時檔案，許可權比較特殊，許可權為“t”

/usr——系統存放程式的目錄，如命令、幫助檔案等

/var——該目錄下的內容經常變動，下有/var/log是存放系統相關日誌的目錄，/var/log/messages中存放系統日誌，/var/log/secure中存放系統安全相關日誌

/root——root使用者的家目錄

對於系統中常見目錄含義的英文解釋可以參考下圖：