下面開始正題，caffe的安裝過程。因為出問題很多，所以實際上我是嘗試了python2和python3兩種python的介面。下面一併放出來。

1. 安裝build-essential

sudo apt-get install
build-essential

這個是一些基本的庫，具體包括哪些，安裝前確認時會顯示，印象中有gcc等等。

2. boost安裝

caffe官網給出的是sudo apt-get install --no-install-recommends libboost-all-dev
我不知道他特意加個--no-install-recommends幹啥。另外，在installation主頁上標明瞭Boost>=1.55

，但是如果用上面那條命令的話，預設裝上的是1.54。我現在還不能完全確定1.54是不是不行，但是為了保險起見，請使用

sudo apt-get install libboost1.55-all-dev

關於boost在makefile.config中的配置，這是個坑，下面詳細講講。

2.1. python2/Anaconda2

對於python2，只要執行完上面的安裝就可以了，makefile中的配置項無需做特別設定。

2.2. python3/Anaconda3

對於python3，boost安裝方面沒啥要留意的。需要特別注意的是makefile.config中，有一行

# Uncomment to use Python 3 (default isPython 2)
PYTHON_LIBRARIES := boost_python-py34python3.5m
 

這一項很有迷惑性，而且我也迷糊了很久，因為相關有一項是PYTHON_LIB，一開始我以為是相同的重複項。但是如果這句stay comment的話，make caffe和pycaffe都能成功通過，但是使用時卻會報錯：

ImportError: /home/zero/Documents/caffe-master/python/caffe/_caffe.so:undefined symbol: 
_ZN5boost6python6detail11init_moduleER11PyModuleDefPFvvE

這個錯誤的意思是，boost版本不匹配。
boost.python是啥東西呢？我理解的是boost.python是一個類似翻譯器的東西，所以如果你是python3的程式，卻用了python2的翻譯器，那語法、定義等等各方面必然會有衝突。我記得在某篇帖子中看到過，str、int等等的定義，在兩者中是不同的，所以有時會有報錯資訊說找不到str啦int啦之類。當時沒有把沒一個錯誤都記下來。
然後，如果我們去makefile中查詢這個變數PYTHON_LIBRARIES，會發現有這麼一句：

PYTHON_LIBRARIES ?= boost_python python2.7
 

這句的意思是說，如果不出意外，使用的是2版本的python和boost.python。但是這裡有個問題，如果把makefile.config裡面那句uncomment，原來預設的是"PYTHON_LIBRARIES :=boost_python3 python3.5m"，直接去掉的話會報錯說找不到-lboost_python3。這裡我無法解釋原理，但是去/usr/lib/x86_64-linux-gnu/資料夾下面去找找，你會找到屬於python3的boost版本，可能是33，也可能是34。確定後，把makefile中的名稱換成相應名稱就可以了。3.5m的，我不瞭解為何要加m。修改後應該是：

PYTHON_LIBRARIES := boost_python-py34python3.5m

3. protobuf安裝

protobuf官方產品預設是不支援python3的，所以通過預設的apt-get命令安裝的libprotobuf和protobuf complier僅適用於python2系列。
而對於python3，以前支援python3的是民間組織搞的一個protobuf-py3，似乎是基於2.5的一個改貨。但是現在下不到了。試過pip3-protobuf，當時也不行。但是現在想來，我或許是之前裝過protobuf2.5沒解除安裝乾淨的關係，如果有興趣的話，倒是可以試試pip3的方式。不過我這裡還是建議手動安裝。
有人在帖子中說protobuf-3.0.0-alpha有問題，我試過也確實不行，但是當時嘗試的環境依然是protobuf2沒卸乾淨，所以到底alpha行不行，這裡說不好，不過我確定beta是可以的，所以我們直接去下載protobuf-3.0.0-beta-2。注意分別下載cpp和python兩個版本的。

解壓後

./configure --prefix=/path/protobuf    # 這裡指定的路徑可以是任意
make
make check
make install

然後配置路徑，將protobuf下的lib和include加入makefile.config，同時，protobuf要加入bashrc裡面。

export PATH=$PATH:/path/protobuf/bin
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/path/protobuf/lib

然後protoc–version檢視版本是否正確。如果顯示的是protoc2.5.0，那是有問題的。我曾經執行apt-get installlibprotobuf-dev，後來又purge解除安裝，但是執行protoc --version後還是能看到2.5.0的資訊。如果是預設系統執行命令後會提示沒有protobuf，所以最好在安裝前先查一下。萬一有，怎麼幹淨的解除安裝，這個我真不清楚。

關於系統許可權問題

這裡講一下系統許可權的問題，初入手ubuntu很容易迷糊，username賬戶、sudo、su這是三個不同的東西。bashrc配置過的路徑僅針對username賬戶有效，怎麼樣能夠全域性有效？理論是是修改/etc/profile，但是實際測試過不太好用。sudo的許可權是不同於su賬戶的，所以下一步安裝python依賴我寧願用su也不要用sudo。理論上修改sudo的配置檔案/etc/sudoers就能夠達到不清除使用者賬戶環境配置的效果，但是實測無效。
然後是pip，系統關聯anaconda3之後，預設pip是anaconda的pip，但是如果你執行sudo pip的話執行的是系統預設python2的pip，這些地方一定要注意。所以後面很多路徑配置後，執行sudo命令會提示找不到這個那個，原因是在做環境變數配置時僅針對當前使用者做了配置。
另外有網優提到過，在caffemake的時候不要用sudo，不然後面會把部分檔案加入許可權限制，導致在make pycaffe的時候出問題。
解壓protobuf的Python版本，進入目錄後

cd Documents/pyprotobuf/protobuf-3.0.0-beta-2/python
python setup.py build
python setup.py test
python setup.py install

最後一步需要sudo或者su許可權。我們還是把su也配置好anaconda，然後進入su賬戶執行安裝。這裡一定要注意python的版本問題，如果裝了anaconda3，那麼username賬戶下面python進去後是3.5.1，這時一定要注意，測試下su賬戶下python進去後是什麼，如果不修改su的bashrc，那麼直接python進去的是2.7.6。可以直接從username下的bashrc中把anaconda的路徑配置copy過去。
安裝完python的protobuf後，進入python進行測試：

Import google.protobuf
from google.protobuf.internal importenum_type_wrapper

3. hdf5

python2/3下照常安裝就好，應該沒什麼太大問題。

sudo apt-get install libhdf5-serial-dev

anaconda自己自帶hdf5，不需要安裝，但是需要注意配置。在makefileconfig中，要把anaconda的lib和include加入路徑配置當中，所以在make的時候，會依照該配置尋找anaconda中的動態連結庫檔案libhdf5.so.10，但是系統找不到，怎麼辦呢？這裡有兩種解決辦法。
一種是在bashrc中加入anaconda的lib路徑：

LD_LIBRARY_PATH=home/zero/anaconda3/lib:$LD_LIBRARY_PATH
exportLD_LIBRARY_PATH

但是這樣會引發別的問題，make時，opencv方面會報錯，

undefined reference [email protected]_4.0'

按照晉倪的文章，這就需要手動安裝opencv，並在配置時設定加上-DBUILD_TIFF=ON
但是我嫌麻煩，所以開闢新路徑。
第二種方式就是對hdf本身動手腳，一種辦法是在/usr/lib/x86_64-linux-gnu
資料夾下面找，看有libhdf5.so.x幾，就把它連結為10，然後make時就找到啦。比如

sudo ln -s libhdf5.so.7 libhdf5.so.10

但是這不就是狸貓換太子？有網友說照著這個做，報錯說libhdf5版本不對。所以可能9換7可以，10換8就不行。然後有個哥們比較逗的是，直接把so檔案複製到/usr/lib/x86_64-linux-gnu資料夾下面，我試了下：

sudo cp libhdf5_hl.so.10/usr/lib/x86_64-linux-gnu/
sudo cp libhdf5.so.10/usr/lib/x86_64-linux-gnu/

然後，似乎是可以的。

4. opencv

python2的我直接就禁用opencv了，所以有興趣可以自己試試看。當時也是報錯
undefined reference [email protected]_4.0'
可能對於python2/3，真的要手動安裝。
對於anaconda，直接照常安裝就行了。

sudo apt-get install libopencv-dev

5.其他

sudo apt-get install libleveldb-devlibsnappy-dev 
sudo apt-get install libatlas-base-dev
sudo apt-get install libgflags-devlibgoogle-glog-dev liblmdb-dev

這些似乎都不會出太大問題。

6. 安裝python依賴庫

anaconda使用者可以跳過此步，這一步僅針對原生python而言。
首先安裝一些必備的編譯器：

sudo apt-get install gcc-gfortran.x86_64
sudo apt-get install gfortran

然後安裝pip（針對python2）：

sudo apt-get install python-pip

或者（針對python3）：

sudo apt-get install python3-pip

使用的時候是pip或者pip3，分別針對兩個版本的python。
然後執行caffe的python下面的requirements.txt中的模組安裝。
官網給出的命令：

for req in $(catrequirements.txt); do pip install $req; done

執行此命令需要su許可權，你可以先進入su賬戶，如果不用su而用sudo的話則命令改為：

for req in $(cat requirements.txt); do sudopip3 install $req; done

不過網上還是看到有人說不要用他的文件，自己一個一個裝比較好。確實在安裝過程中會有不能完全安裝而留意不到的情況，所以最好手動安裝，沒裝完一個看返回資訊是否是安裝成功。例如：

sudo pip3 install 'python-gflags>=2.0'

需要選擇版本的話記得加引號。

7. 安裝caffe及配置makefile檔案

先下載Caffe。github上下載好caffe庫：https://github.com/BVLC/caffe，複製到ubuntu下，解壓。然後按照官網說法修改config
cd /home/zero/Documents/caffe-master
cp Makefile.config.example Makefile.config
直接用gedit開啟

CPU_ONLY := 1 #這句要去掉comment。因為我們只用cpu
# USE_OPENCV := 0 #不用opencv的話也可以去掉，不過最好留著吧。我是在python2下面實在懶才去掉的。
PYTHON_INCLUDE := /usr/include/python2.7 \
              /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include
# 這兩句，如果是要用python3或者anaconda，一概去掉，如果是原生python2.7，下面的要改為/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include
ANACONDA_HOME := /home/zero/anaconda3
PYTHON_INCLUDE := $(ANACONDA_HOME)/include\
              $(ANACONDA_HOME)/include/python3.5m\
              $(ANACONDA_HOME)/lib/python3.5/site-packages/numpy/core/include\
# 注意是anaconda3，或者anaconda2，帶了數字的
PYTHON_LIBRARIES := boost_python-py34python3.5m
# 這句前面講過，boost版本的問題。
# PYTHON_LIB := /usr/lib
PYTHON_LIB := $(ANACONDA_HOME)/lib
# 預設就用上面的，anaconda就用下面的。
INCLUDE_DIRS := $(PYTHON_INCLUDE)/usr/local/include /usr/local/protobuf/include
LIBRARY_DIRS := $(PYTHON_LIB)/usr/local/lib /usr/lib /usr/local/protobuf/lib
# 注意後面手動添加了protobuf的庫。

8. make

在caffe根目錄下

make
make test
make runtest
make pycaffe
make pytest

如果測試都通過，那就沒問題了。注意配置檔案裡面有一個

WITH_PYTHON_LAYER := 1

如果這句的註釋去掉就不能pytest了。記得googlegroup上有人這麼說過。

9. 配置環境變數：

export PATH=$PATH:/usr/local/protobuf/bin
exportLD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/protobuf/lib

這兩句是配置protobuf的，手動安裝3beta2之後，要新增這兩句，不然系統找不到你安裝的protobuf。如果是2系列的不需要執行這一步。

# added by Anaconda34.0.0
installer
exportPATH="/home/zero/anaconda3/bin:$PATH"

上面這個是安裝anaconda3的時候自動新增的，如果在問你要不要新增時你直接回車no了，那回頭自己添上這一句。否則python進去的還是系統自帶的python2。前面提到過，晉倪的文章中說建議

LD_LIBRARY_PATH=home/zero/anaconda3/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export LD_LIBRARY_PATH

說如果不加就會進不去系統。我沒遇到進不去系統的情況。反而是加了這兩句會導致opencv的報錯。

exportPYTHONPATH=/home/zero/Documents/caffe-master/python:$PYTHONPATH

最後這句是caffe的配置，有人居然說可以配置為caffe/build/python，嚴重誤導了我……

10. 驗證

最後還是需要仔細驗證一下，不然可能空歡喜一場
python進去後

import caffe

如果不報錯也別急著高興

from caffe import layers as L

如果這句也不報錯，那應該是不會有問題了。
萬一第一句成功了結果第二句沒成功，可能是路徑配錯了，用dir(caffe)看看caffe都有些啥。我第一次海市蜃樓的時候只有
['__doc__', '__loader__', '__name__','__package__', '__path__', '__spec__']。說明是有問題的。
最後
雖然自己極盡所能想要做到沒有遺漏，但是由於caffe安裝過程本身重複了太多次，每次錯誤都不同，我沒有時間一一記錄和呈現。萬一有所疏漏，請及時指出。
關於參考資料，看了太多的博文，沒辦法一一列出，而且根本系統、環境的不同，操作方法也有太多的不一樣。這裡要感謝google user group上面的兩位網友，針對我的問題他們直接給出了很好的建議。