Centos下安裝freesurfer、fsl、matlab
阿新 • • 發佈:2019-01-28
freesurfer:
freesurfer好安裝,只需要下載官網原始碼包,如freesurfer5.3.tar.gz
下載至本地,解壓:
tar zxvf freesurfer5.3.tar.gz -C /software/freesurfer5.3
其中,-C選項能夠設定解壓路徑
然後只需要在本地使用者的.bashrc下設定freesurfer變數即可:
gedit ~/.bashrc:
export FREESURFER_HOME=/software/freesurfer5.3
source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh
export PATH=/software/freesurfer5.3/bin:$PATH
fsl:
ubuntu下安裝見官網
Centos系統下安裝過程:
網路正常時,直接執行fslinstaller.py檔案:
./fslinstaller.py或者python fslinstaller.py
網路不好時,需要在一臺網路好的機器上下載原始碼包:(我就遇到過這種情況)
./fslinstaller.py -o
安裝好後,在.bashrc下新增:
export PATH=/mnt/sys/Programs/fsl/bin:$PATH
export FSLDIR=/mnt/sys/Programs/fsl
source $FSLDIR/etc/fslconf/fsl.sh
matlab:
安裝包裡有安裝指令碼,執行即可,然後按照下載裡面的啟用步驟進行啟用。