0057-【生物資料庫】-如何進行RNA差異基因的GeneName對應轉為Gene ID
無論是網頁版還是R包,建議使用Gene ID,這樣就不需要物種的混淆
1. 網站DAVID
寫程式的思路:
在NCBI或者esemble下載所有的基因ID的檔案,如果以後需要,則根據兩列關係提取
2. 進入 Gene ID Conversion 工具欄
進入轉換工具
輸入轉換列表的內容
選擇物種
返回工具頁面,此時已經記憶了輸入列表
選擇轉換工具
開始轉換
轉換完成,另存為輸出表格
相關推薦
0057-【生物資料庫】-如何進行RNA差異基因的GeneName對應轉為Gene ID
無論是網頁版還是R包,建議使用Gene ID,這樣就不需要物種的混淆 1. 網站DAVID 寫程式的思路: 在NCBI或者esemble下載所有的基因ID的檔案,如果以後需要,則根據兩列關
【MySQL資料庫】效能優化之索引及優化(一)
一、Mysql效能優化之影響效能的因素 1.商業需求的影響 不合理的需求造成的資源投入產出,這裡就用一個看上去很簡單的功能分析。需求:一個論壇帖子的總量統計,附加要求:實時更新。從功能上看來是非常容易實現的,執行一條select count(*)from表名就可以得到結果,但是如果我們採
【gp資料庫】查詢模式下所有函式名稱(附帶引數資訊)
本篇主要目的是查詢模式下函式名稱,其中用到自定義型別轉換的方法,為了將引數拼接起來 pg_pro表儲存函式資訊,其中proargtypes欄位表示輸入引數型別。這個欄位是oidvector型別的,查了好多資料也沒找到這是個啥型別,怎麼和pg_type.oid做關聯。於是還是自定義型別轉換吧!
【gp資料庫】查詢函式中引用資料表資訊
函式指令碼寫得多了,再想統計整理用到的表資訊十分麻煩。甚至存在歷史資料表不再使用的情況,所以需要根據條件對函式引用表資訊進行統計。本篇介紹我常用的指令碼。 1. 查詢某資料表在哪些函式中引用過 select proname from pg_proc w
【Redis資料庫】命令學習筆記——釋出訂閱、事務、指令碼、連線命令彙總
本篇基於redis 4.0.11版本,學習釋出訂閱、事務、指令碼、連線的相關命令。 Redis 釋出訂閱(pub/sub)是一種訊息通訊模式:傳送者(pub)傳送訊息,訂閱者(sub)接收訊息。 序
【Redis資料庫】再有人問你CAP理論是什麼,就把這篇文章發給他
CAP是Consistency(一致性),Availability(可用性),Partition tolerance(分割槽容錯性)的縮寫。在學習redis過程中看到這個名詞,查詢各位大佬的文章發現這篇講得很簡單清晰,文章來自公眾號:codewill。 CAP 定理(C
( 一) 建表規約 -【MySQL資料庫】
【強制】表達是與否概念的欄位,必須使用 is _ xxx 的方式命名,資料型別是 unsigned tinyint ( 1 表示是,0 表示否 ) 。 說明:任何欄位如果為非負數,必須是 unsigned 。 正例:表達邏輯刪除的欄位名 is_deleted ,1 表示刪除,0
【LeetCode--資料庫】分數排名
178. Rank Scores(中等) 題目:編寫一個sql語句來實現分數排名,如果兩個分數相同,則兩個分數排名(Rank)相同,而且下一個名次應該是下一個連續的整數值,也就是說,名次之間不能有間隔。 +----+-------+ | Id | Score | +---
【mysql資料庫】python指令碼執行SQL語句,關於字串變數的注意事項
轉載一篇網友介紹Python 資料庫的Connection、Cursor兩大物件,寫的非常好。 https://blog.csdn.net/guofeng93/article/details/53994112 最新在使用python操作資料庫,發現使用cursor.exec
068:【Django資料庫】ORM查詢條件詳解-date、time、year、week_day等
【Django資料庫】ORM查詢條件詳解-date、time、year、week_day等: year:根據年份進行查詢。示例程式碼如下: articles = Article.objects.filter(create_time__year=2018) articles = Article.obj
【LeetCode--資料庫】工資問題
627. 交換工資(簡單) 題目:給定一個salary 表,如下所示,有m=男性 和 f=女性的值 。交換所有的 f 和 m 值(例如,將所有 f 值更改為 m,反之亦然)。要求使用一個更新查詢,並且沒有中間臨時表 | id | name | sex | salary |
071:【Django資料庫】ORM聚合函式詳解-Avg
ORM聚合函式詳解-Avg: Avg:求平均值。比如想要獲取所有圖書的價格平均值。那麼可以使用以下程式碼實現: from django.db.models import Avg result = Book.objects.aggregate(Avg('price')) print(result
073:【Django資料庫】ORM聚合函式詳解-Count
ORM聚合函式詳解-Count: Count :獲取指定的物件的個數。示例程式碼如下: from django.db.models import Count result = Book.objects.aggregate(book_num=Count('id')) 以上的 result 將返回
075: 【Django資料庫】ORM聚合函式詳解-Sum
ORM聚合函式詳解-Sum: Sum :求指定物件的總和。比如要求圖書的銷售總額。那麼可以使用以下程式碼實現: from djang.db.models import Sum result = Book.objects.annotate(total=Sum("bookstore__price")).
七、sql基礎:1.DML語句--【Oracle資料庫】
####七、DML語句 Data Manipulation Language,資料操縱語言,增刪改。 #####1. INSERT語句 ######1.1 格式一 insert into student (stu_id, stu_name) values(1
076:【Django資料庫】F表示式詳解
F表示式詳解: F表示式 是用來優化 ORM 操作資料庫的。比如我們要將公司所有員工的薪水都增加1000元,如果按照正常的流程,應該是先從資料庫中提取所有的員工工資到Python記憶體中,然後使用Python程式碼在員工工資的基礎之上增加1000元,最後再儲存到資料庫中。這裡面涉及的流程就是,首先從資料庫中
077:【Django資料庫】Q表示式詳解
Q表示式詳解: 如果想要實現所有價格高於100元,並且評分達到9.0以上評分的圖書。那麼可以通過以下程式碼來實現: books = Book.objects.filter(price__gte=100,rating__gte=9) 以上這個案例是一個並集查詢,可以簡單的通過傳遞多個條件進去來實
079:【Django資料庫】QuerySet API詳解-filter、exclude、annotate
QuerySet API詳解-filter、exclude、annotate: 在使用 QuerySet 進行查詢操作的時候,可以提供多種操作。比如過濾完後還要根據某個欄位進行排序,那麼這一系列的操作我們可以通過一個非常流暢的 鏈式呼叫 的方式進行。比如要從文章表中獲取標題為 123 ,並且提取後
【Java 資料庫】java工程通過JDBC連線到資料庫
(在原博文上有改動) 下面請一字一句地看,一遍就設定成功,比你設定幾十遍失敗,費時會少得多。 首先,在連線資料庫之前必須保證SQL Server 2012是採用SQL Server身份驗證方式而不是windows身份驗證方式。如果在安裝時選用了後者,則重新設定如下:
【LeetCode--資料庫】換座位
626.換座位(中等) 題目:小美是一所中學的資訊科技老師,她有一張seat 座位表,平時用來儲存學生名字和與他們相對應的座位id,其中縱列的 id 是連續遞增的,小美想改變相鄰倆學生的座位,寫一個 SQL query 來輸出小美想要的結果 注意:如果學生人數是奇數,則不