網上有相關文章，但不全，一方面是限制了http訪問，需要在info.plist中設定下：

<key>NSAppTransportSecurity</key>
	<dict>
		<key>NSAllowsArbitraryLoads</key>
		<true/>
	</dict>

另一方面，是介面跳轉，將要使用的URL Schemes設定為白名單：

<key>LSApplicationQueriesSchemes</key>
	<array>
		<string>alipay</string>
		<string>wechat</string>
		<string>weixin</string>
	</array>
 

這個微信的sdk 1.6更新了，其中說明文件有說到，支付寶暫沒有找到。readme檔案如下

重要!
SDK1.6
1、iOS 9系統策略更新，限制了http協議的訪問，此外應用需要在“Info.plist”中將要使用的URL Schemes列為白名單，才可正常檢查其他應用是否安裝。
受此影響，當你的應用在iOS 9中需要使用微信SDK的相關能力（分享、收藏、支付、登入等）時，需要在“Info.plist”裡增加如下程式碼：

<key>LSApplicationQueriesSchemes</key>
<array>
    <string>weixin</string>
</array>

<key>NSAppTransportSecurity</key>
<dict>
    <key>NSAllowsArbitraryLoads</key>
    <true/>
</dict>
或者配置白名單域名pingma.qq.com

2、開發者需要在工程中連結上 CoreTelephony.framework
3、解決bitcode編譯不過問題
 

另外，微信支付demo中有用到libsqlite3.dylib和libz.dylib，但是在xcode 7.0中找不到了，參考stackoverflow上的方法新增，能正常編譯（因為之前找不到檔案標紅，我刪了後編譯不通過），見連結：http://stackoverflow.com/questions/30815806/swift-2-ios-9-libz-dylib-not-found

I had the same problem. I found some kind of way around.

Go to Build Phases >Link Binary with Librairies > + > Add other
Once in the file selection window do "CMD"+Shift+G (Go to folder) and type /usr/lib/
From /user/lib you can add : libz.dylib and more...
Compile and have fun
 

大概就是這樣啦，現在支付寶和微信支付在iOS 9.0下都能正常使用