使用Cytoscape 的BinGO外掛繪製GO通路關係圖
Cytoscape：BinGO外掛實戰
繪圖目標
繪圖實戰步驟
Cytoscape 軟體的安裝
BinGO 外掛安裝
開啟CytoScape 軟體，在最上方找到Apps, 選擇App Manager, 搜尋BinGO,即可下載安裝。
繪圖開始
安裝好BinGO之後，開啟BInGO,按照如下說明填寫分析需求
填寫完成後，點選start BinGO，就可以了。
輸出結果
輸出結果有兩部分，一個是在上述輸出路徑中生成一個字尾為bgo的檔案，另一個是在Cytoscape 上彈出一個結果頁面，這兩個輸出結果的內容是一致的。
繪圖調整
上述步驟分析完後會直接在cytoscape 頁面生成繪圖結果，如下
假如覺得不夠美觀，該如何調整呢？
可以參考下圖的設定。
顏色及節點大小的含義說明：
氣泡的大小由nodesize決定，他與該通路內的基因數量成正比。
顏色是按照P值上色，會有一個條帶是單獨形成的 如下圖所示。
到此就大功告成了！是不是很簡單呢！
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