Kubernetes 部署 Nebula 圖資料庫叢集
阿新 • • 發佈:2021-03-03
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## Kubernetes 是什麼
Kubernetes 是一個開源的,用於管理雲平臺中多個主機上的容器化的應用,Kubernetes 的目標是讓部署容器化的應用簡單並且高效,Kubernetes 提供了應用部署,規劃,更新,維護的一種機制。
Kubernetes 在設計結構上定義了一系列的構建模組,其目的是為了提供一個可以**部署、維護和擴充套件應用程式的機制**,組成 Kubernetes 的元件設計理念為**鬆耦合**和**可擴充套件**的,這樣可以使之滿足多種不同的工作負載。可擴充套件性在很大程度上由 Kubernetes API 提供,此 API 主要被作為擴充套件的內部元件以及 Kubernetes 上執行的容器來使用。
![k8s-architecture](https://www-cdn.nebula-graph.com.cn/nebula-blog/k8s01.png)
Kubernetes 主要由以下幾個核心元件組成:
- `etcd` 儲存了整個叢集的狀態
- `kube-apiserver` 提供了資源操作的唯一入口,並提供認證、授權、訪問控制、API 註冊和發現等機制
- `kube-controller-manager` 負責維護叢集的狀態,比如故障檢測、自動擴充套件、滾動更新等
- `kube-scheduler` 負責資源的排程,按照預定的排程策略將Pod排程到相應的機器上
- `kubelet` 負責維護容器的生命週期,同時也負責 Volume和網路的管理
- `kube-proxy` 負責為 Service 提供 cluster 內部的服務發現和負載均衡
## Kubernetes 和資料庫
資料庫容器化是最近的一大熱點,那麼 Kubernetes 能為資料庫帶來什麼好處呢?
- **故障恢復**:Kubernetes 提供故障恢復的功能,資料庫應用如果宕掉,Kubernetes 可以將其**自動重啟**,或者將資料庫例項遷移到叢集中其他節點上
- **儲存管理**:Kubernetes 提供了豐富的儲存接入方案,資料庫應用能**透明地使用不同型別的儲存系統**
- **負載均衡**:Kubernetes Service 提供負載均衡功能,能將外部訪問均衡到不同的資料庫例項副本上
- **水平拓展**:Kubernetes 可以根據當前資料庫叢集的資源利用率情況,縮放副本數目,從而提升資源的利用率
目前很多資料庫,如:MySQL,MongoDB 和 TiDB 在 Kubernetes 叢集中都能執行良好。
## Nebula Graph 在 Kubernetes 中的實踐
Nebula Graph 是一個分散式的開源圖資料庫,主要元件有:Query Engine 的 graphd,資料儲存的 storaged,和元資料的 meted。在 Kubernetes 實踐過程中,它主要給圖資料庫 Nebula Graph 帶來了以下的好處:
- Kubernetes 能均衡 nebula graphd,metad 和 storaged 不同副本之間的負載。graphd,metad 和 storaged 可以通過 Kubernetes 的域名服務自動發現彼此。
- 通過 StorageClass,PVC 和 PV 可以遮蔽底層儲存細節,無論使用本地卷還是雲盤,Kubernetes 均可以透明對接。
- 通過 Kubernetes 可以在數秒內成功部署一套 Nebula 叢集,Kubernetes 也可以無感知地實現 Nebula 叢集的升級。
- Nebula 叢集通過 Kubernetes 可以做到自我恢復,單體副本 crash,Kubernetes 可以重新將其拉起,無需運維人員介入。
- Kubernetes 可以根據當前 Nebula 叢集的資源利用率情況彈性伸縮叢集規模,從而提升叢集的效能。
下面來講解下具體的實踐內容。
### 叢集部署
#### 硬體和軟體要求
這裡主要羅列下本文部署涉及到的機器、作業系統引數
- 作業系統使用的 CentOS-7.6.1810 x86_64
- 虛擬機器配置
- 4 CPU
- 8G 記憶體
- 50G 系統盤
- 50G 資料盤 A
- 50G 資料盤 B
- Kubernetes 叢集版本 v1.14+
- Nebula 版本為 v2.0.0-rc1
- 使用本地 PV 作為資料儲存
- CoreDNS 版本 1.6.0+
#### K8s 叢集規劃
以下為叢集清單
| 伺服器 IP | nebula 例項 | role |
| --- | --- | --- |
| 192.168.0.1 | | master |
| 192.168.0.2 | graphd, metad-0, storaged-0 | node |
| 192.168.0.3 | graphd, metad-1, storaged-1 | node |
| 192.168.0.4 | graphd, metad-2, storaged-2 | node |
#### K8s 待部署元件
- 安裝 Helm3
- 準備本地磁碟,並安裝本地卷外掛
- 安裝 nebula 叢集
### 安裝 Helm3
Helm 是 Kubernetes 叢集上的包管理工,使用 Helm 可以極大地降低使用 Kubernetes 部署應用的門檻。本文不做 Helm 詳細介紹,有興趣的小夥伴可自行閱讀[《Helm 入門指南》](https://helm.sh/zh/docs/intro/quickstart/)。
#### 下載安裝 Helm
使用下面命令在終端執行即可安裝 Helm
```bash
$ wget https://get.helm.sh/helm-v3.5.2-linux-amd64.tar.gz
$ tar -zxvf helm/helm-v3.5.2-linux-amd64.tgz
$ mv linux-amd64/helm /usr/bin/helm
```
#### 檢視 Helm 版本
執行 `helm version` 命令即可檢視對應的 Helm 版本,以文字為例,以下為輸出結果:
```bash
version.BuildInfo{Version:"v3.5.2", GitCommit:"167aac70832d3a384f65f9745335e9fb40169dc2", GitTreeState:"dirty", GoVersion:"go1.15.7"}
```
### 設定本地磁碟
在每臺機器上做如下配置
#### 建立 mount 目錄
```bash
$ sudo mkdir -p /mnt/disks
```
#### 格式化資料盤
```bash
$ sudo mkfs.ext4 /dev/diskA
$ sudo mkfs.ext4 /dev/diskB
```
#### 掛載資料盤
```bash
$ DISKA_UUID=$(blkid -s UUID -o value /dev/diskA)
$ DISKB_UUID=$(blkid -s UUID -o value /dev/diskB)
$ sudo mkdir /mnt/disks/$DISKA_UUID
$ sudo mkdir /mnt/disks/$DISKB_UUID
$ sudo mount -t ext4 /dev/diskA /mnt/disks/$DISKA_UUID
$ sudo mount -t ext4 /dev/diskB /mnt/disks/$DISKB_UUID
$ echo UUID=`sudo blkid -s UUID -o value /dev/diskA` /mnt/disks/$DISKA_UUID ext4 defaults 0 2 | sudo tee -a /etc/fstab
$ echo UUID=`sudo blkid -s UUID -o value /dev/diskB` /mnt/disks/$DISKB_UUID ext4 defaults 0 2 | sudo tee -a /etc/fstab
```
### 部署本地卷外掛
```bash
$ curl https://github.com/kubernetes-sigs/sig-storage-local-static-provisioner/archive/v2.4.0.zip
$ unzip v2.4.0.zip
```
修改 `v2.4.0/helm/provisioner/values.yaml` classes 部分:
- 將 `hostDir: /mnt/fast-disks` 改成 `hostDir: /mnt/disks`,`# storageClass: true` 改成 `storageClass: true`。然後執行:
```bash
$ helm install local-static-provisioner --namespace default sig-storage-local-static-provisioner/helm/provisioner
# 檢視 local-static-provisioner 部署情況
$ helm list
NAME NAMESPACE REVISION UPDATED STATUS CHART APP VERSION
local-volume-provisioner default 1 2021-02-10 11:06:34.3540341 +0800 CST deployed provisioner-2.4.0 2.4.0
```
### 部署 nebula 叢集
#### 下載 nebula helm chart
```bash
# 下載 nebula chart
$ helm repo add nebula-charts https://vesoft-inc.github.io/nebula-docker-compose
$ helm pull nebula-charts/nebula
$ tar -zxvf nebula-v2.0.0.tgz
```
#### 設定 Kubernetes node節點
下面是 Kubernetes 節點列表,我們需要設定 node 節點的排程標籤。可以將 _192.168.0.2_,_192.168.0.3_,_192.168.0.4_ 打上 `nebula: "cloud"` 的標籤。
| 伺服器 IP | kubernetes roles | nodeName |
| --- | --- | --- |
| 192.168.0.1 | master | 192.168.0.1 |
| 192.168.0.2 | node | 192.168.0.2 |
| 192.168.0.3 | node | 192.168.0.3 |
| 192.168.0.4 | node | 192.168.0.4 |
具體操作如下:
```bash
$ kubectl label node 192.168.0.2 nebula="cloud" --overwrite
$ kubectl label node 192.168.0.3 nebula="cloud" --overwrite
$ kubectl label node 192.168.0.4 nebula="cloud" --overwrite
```
#### 調整 values 預設值
nebula helm chart 目錄如下:
```bash
nebula
├── Chart.yaml
├── README.md
├── templates
│ ├── configmap.yaml
│ ├── deployment.yaml
│ ├── _helpers.tpl
│ ├── NOTES.txt
│ ├── pdb.yaml
│ ├── serviceaccount.yaml
│ ├── service.yaml
│ └── statefulset.yaml
└── values.yaml
1 directory, 11 files
```
可以根據執行環境需求修改 `charts/nebula/values.yaml` 裡面的預設值
#### 通過 helm 安裝 nebula
```bash
$ helm install nebula charts/nebula
# 檢視部署狀態
$ helm status nebula
NAME: nebula
LAST DEPLOYED: Fri Feb 19 12:58:16 2021
NAMESPACE: default
STATUS: deployed
REVISION: 1
TEST SUITE: None
NOTES:
Nebula Graph Cluster installed!
1. Watch all containers come up.
$ kubectl get pods --namespace=default -l app.kubernetes.io=nebula -w
# 檢視 K8s 叢集上 nebula 部署情況
$ kubectl get pods --namespace=default -l app.kubernetes.io=nebula
NAME READY STATUS RESTARTS AGE
nebula-graphd-676cfcf797-4q7mk 1/1 Running 0 6m
nebula-graphd-676cfcf797-whwqp 1/1 Running 0 6m
nebula-graphd-676cfcf797-zn5l6 1/1 Running 0 6m
nebula-metad-0 1/1 Running 0 6m
nebula-metad-1 1/1 Running 0 6m
nebula-metad-2 1/1 Running 0 6m
nebula-storaged-0 1/1 Running 0 6m
nebula-storaged-1 1/1 Running 0 6m
nebula-storaged-2 1/1 Running 0 6m
```
#### 訪問 nebula 叢集:
```bash
$ kubectl get service nebula-graphd
NAME TYPE CLUSTER-IP EXTERNAL-IP PORT(S) AGE
nebula-graphd NodePort 10.105.4