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C#開發PACS醫學影像三維重建(一):使用VTK重建3D影像

VTK簡介:

VTK是一個開源的免費軟體系統,主要用於三維計算機圖形學、影象處理和視覺化。Vtk是在面向物件原理的基礎上設計和實現的,它的核心是用C++構建的。

因為使用C#語言開發,而VTK是C++的,所以推薦使用VTK的.Net開發庫:ActiViz。

本系列文章主要以技術和程式碼講解為主,ActiViz的安裝和環境配置可以參考:

ActiViz(VTK的C#庫)學習使用心得之二:Activiz.NET的下載和安裝

官網資料:https://www.kitware.eu/product/activiz

三維重建技術介紹:

對於一些複雜的影象,醫生希望用三維重建來觀察病灶點來輔助診斷,一般在醫學領域內的三維重建型別分為以下六種:

多層面重建(MPR)

最大密度投影(MIP)

表面陰影遮蓋(SSD)

容積漫遊技術(VR)

曲面重建(CPR)

虛擬內鏡技術(VE)

本系列教程最終效果(實際效果受顯示卡能力決定):

當我們下載並安裝好ActiViz之後,準備好要三維重建的Dcm檔案,在VS2017中新建一個桌面應用程式專案:

引用相關的動態庫:

在Form1的Load事件中:

        private void Form1_Load(object sender, EventArgs e)
        {
        //建立資料讀取物件
            vtkDICOMImageReader reader = new
vtkDICOMImageReader(); //小端位元組 reader.SetDataByteOrderToLittleEndian(); //設定切片資料路徑 reader.SetDirectoryName(@"C:\Users\Administrator\Desktop\vtk\801"); vtkImageShrink3D shrink = new vtkImageShrink3D(); shrink.SetShrinkFactors(4, 4
, 1); shrink.AveragingOn(); shrink.SetInput((vtkDataObject)(reader.GetOutput())); //提取等值面 vtkMarchingCubes skinExtractor = new vtkMarchingCubes(); //建立演算法物件,從CT切片資料中提取出面板 skinExtractor.SetValue(0, 50); //提取出CT值為50的組織 skinExtractor.SetInputConnection(shrink.GetOutputPort()); vtkDecimatePro deci = new vtkDecimatePro(); deci.SetTargetReduction(0.3); deci.SetInputConnection(skinExtractor.GetOutputPort()); vtkSmoothPolyDataFilter smooth = new vtkSmoothPolyDataFilter(); //光滑影象 smooth.SetInputConnection(deci.GetOutputPort()); smooth.SetNumberOfIterations(200); vtkPolyDataNormals skinNormals = new vtkPolyDataNormals(); //法線 skinNormals.SetInputConnection(smooth.GetOutputPort()); skinNormals.SetFeatureAngle(60.0); vtkStripper stripper = new vtkStripper(); stripper.SetInputConnection(skinNormals.GetOutputPort()); vtkDataSetMapper skinMapper = new vtkDataSetMapper(); skinMapper.SetInput(stripper.GetOutput()); skinMapper.ScalarVisibilityOff(); //設定相機 vtkCamera aCamera = new vtkCamera(); aCamera.SetViewUp(0, 0, -1); aCamera.SetPosition(0, 1, 0); aCamera.SetFocalPoint(0, 0, 0); aCamera.ComputeViewPlaneNormal(); //設定Actor vtkActor coneActor = new vtkActor(); coneActor.SetMapper(skinMapper); coneActor.GetProperty().SetAmbient(0.5); coneActor.GetProperty().SetDiffuse(1); coneActor.GetProperty().SetSpecular(0.6); //顯示類 vtkRenderer renderer = renderWindowControl1.RenderWindow.GetRenderers().GetFirstRenderer(); renderer.AddActor(coneActor);//新增coneActor物件 //renderer.AddActor2D(new vtkProp());//新增textActor物件 renderer.SetBackground(0, 0, 0); renderer.SetActiveCamera(aCamera);//新增相機 renderer.ResetCamera(); vtkRenderWindow renWin = renderWindowControl1.RenderWindow;//設定繪圖視窗renWin->AddRenderer(renderer);//裝載繪圖類 vtkWin32RenderWindowInteractor iren = new vtkWin32RenderWindowInteractor(); iren.SetRenderWindow(renWin);//裝載繪圖視窗
}

這裡我用的是頭顱的CT影像切片,執行後就得到了一個未上色的三維模型:

修改上面的程式碼,嘗試提取腦部血管模型:

 //建立演算法物件,從CT切片資料中提取出面板
skinExtractor.SetValue(0, 250); //血管CT值為200-300左右

C#開發PACS、RIS醫學影像處理系統

目錄整理:

(一)PACS客戶端:

C#開發PACS醫學影像處理系統(一):開發背景和功能預覽

C#開發PACS醫學影像處理系統(二):介面佈局之選單欄

C#開發PACS醫學影像處理系統(三):介面佈局之工具欄

C#開發PACS醫學影像處理系統(四):介面佈局之狀態列

C#開發PACS醫學影像處理系統(五):查詢病人資訊列表

C#開發PACS醫學影像處理系統(六):載入Dicom影像

C#開發PACS醫學影像處理系統(七):讀取影像Dicom資訊

C#開發PACS醫學影像處理系統(八):單元格變換

C#開發PACS醫學影像處理系統(九):序列控制元件與拖拽

C#開發PACS醫學影像處理系統(十):Dicom影像下載策略與演算法

C#開發PACS醫學影像處理系統(十一):Dicom影像掛片協議

C#開發PACS醫學影像處理系統(十二):繪圖處理之圖形標記

C#開發PACS醫學影像處理系統(十三):繪圖處理之病灶測量

C#開發PACS醫學影像處理系統(十四):處理Dicom影像窗寬窗位

C#開發PACS醫學影像處理系統(十五):Dicom影像交叉定位線演算法

C#開發PACS醫學影像處理系統(十六):2D處理之影像平移和縮放

C#開發PACS醫學影像處理系統(十七):2D處理之影像旋轉和翻轉

C#開發PACS醫學影像處理系統(十八):Dicom使用LUT色彩增強和反色

C#開發PACS醫學影像處理系統(十九):Dicom影像放大鏡

(二)PACS三維:MRP、MIP、VR

C#開發PACS醫學影像三維重建(一):使用VTK重建3D影像

(三)PACS網頁端:開發Web版本的PACS

C#開發Web端PACS(一):基於PACS客戶端思想重寫Web端

(四)PACS移動端:開發基於HTML5移動端版本的PACS

C#開發移動端PACS(一):使用HTML5和CSS3開發PACS手機端頁面

C#開發移動端PACS(二):使用 .Net MVC 開發手機端PACS服務端

(五)PACS服務端:

C#開發PACS醫學影像處理系統服務端(一):醫療裝置的連線與收圖

C#開發PACS醫學影像處理系統服務端(二):高併發架構

(六)PACS與RIS系統的通訊與整合

在RIS系統中調起PACS並開啟Dicom影像

(七)雲PACS與遠端會診

C#開發PACS醫學影像處理系統之雲PACS(區域PACS)(一):架構概述

C#開發PACS醫學影像處理系統之雲PACS(區域PACS)(二):遠端會診與雙向轉診

(八)科幻級視訊特效:使用Adobe After Effects 製作PACS影像處理系統宣傳視訊

QQ:1850969244

近10年開發經驗,主攻C#、ASP MVC,HTML5,

B/S C/S 皆可,目前研究醫療領域醫學影像相關技術,

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