共線性分析-MCscan - python (jcvi)
阿新 • • 發佈:2020-11-03
本來是不會再寫這個文件的,但是由於長時間沒有用這個模組,這個模組不知道是我自己弄掉了,還是別的同學誤刪了,於是我重新安裝一下。
首先下載conda,並下載好python
which pip
直接安裝
注意:
1. 請下載conda3版本,本模組由python3支援;
2. home目錄和電腦C盤一樣,如果home空間有限,請安裝在其他目錄下;
3. 將python執行路勁寫進bashrc(類似Windows的登錄檔)
等著就行了:
其他模組自己安裝就行了(Knet tools, Bedtools, EMBOSS),我這裡只作圖,不需要重新檢查之前的是否能用。
一切準備就緒之後,這裡是後續的多序列比對分析。
後期詳見github和微信公眾號,微信公眾號會提供指令碼和分析思路,從中可以學到程式設計的知識。
下載速度有點慢,去重新申請github號,之前的名字不好看,密碼忘了,先重置密碼。
重置了密碼還說不對,看看密碼是不是輸錯了,按F12
這裡改成text就能看到自己密碼了,確認沒錯。
好了,17分鐘之後,安裝完成;
然後繼續安裝拓展版本:
pip install git+git://github.com/tanghaibao/jcvi.git
安裝完後,可以去我的GitHub找指令碼了。
指令碼都未發表,使用請標明出處,謝謝!
https://github.com/Yuan-SW-F/Syntenic
以上,
文淵