生信算法實踐
最近在搞16S,發現了一個實踐算法的最佳機會。
見文章:
A Bayesian taxonomic classification method for 16S rRNA gene sequences with improved species-level accuracy.
文章利用了貝葉斯模型,調用了blast和muscle來對OTU進行taxonomy assignment。
可以看一下源代碼,非常簡單。
Bayesian-based LCA taxonomic classification method
如果你能徹底理解本文的算法,並能看懂其源碼,那你基本就打到了生信算法入門的水平。
說不定以後你也能隨手發一個算法的文章哦!
生信算法實踐
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