drop 體積 構建 pan 以及 lex 建議 nod 1.8

宏基因組測序：

1. 濃度>=50ng/ul
2. OD260/280：1.8-2.0
3. DNA兩次需要量>=3ug

宏基因組測序需要提供什麽樣品要求？ （1）提供環境微生物的基因組DNA或者擴增產物，OD值在1.8～2.0 之間；樣品濃度大於30 ng/ul；每次樣品制備需要10μg樣品，如果需要多次制備樣品，則需要樣品總量=制備樣品次數*10 ug。 （2）DNA樣品請置於-20℃保存；請提供DNA樣品具體濃度、體積、制備時間、溶劑名稱。請同時附上QC數據，包括電泳膠圖、分光光度或Nanodrop儀器檢測數據。 （3）樣品請置於1.5 ml管中，管上註明樣品名稱、濃度以及制備時間，管口使用Parafilm封口。建議使用幹冰運輸，並且盡量選用較快的郵遞方式，以降低運輸過程中樣品降解的可能性。 采用Solexa進行宏基因組測序，測序文庫構建方法及質量控制如何？ 答：采用Solexa進行宏基因組 DNA測序，首先對特定環境微生物種群全基因組DNA進行提取。在提取微生物種群的DNA後制備DNA文庫，具體步驟如下： （1）將DNA隨機打斷成200-500bp的片段； （2）對DNA末端進行修復； （3）將“A”堿基加入到DNA片段的3’末端； （4）在DNA片段的末端加上接頭； （5）純化連接產物； （6）PCR擴增連上接頭的DNA片段； （7）檢測測序文庫。

宏基因組測序及分析