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24、嵌合體序列

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轉載:http://www.cnblogs.com/xudongliang/p/6497465.html

嵌合體序列:由來自兩條或者多條模板鏈的序列組成,示意圖如下:

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在PCR反應中,在延伸階段,由於不完全延伸,就會導致嵌合體序列的出現,以上圖為例,

在擴增序列X的過程中,在序列延伸階段,只產生了部分X序列延伸階段就結束了,在下一輪的PCR反應中,這部分序列作為其相似序列Y的引物接著延伸,擴增就會形成X和Y的嵌合體序列;

在放一張具體一點的示意圖,不完全延伸產生的序列作為下一輪PCR反應的產物,進行延伸

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在PCR過程中,大概有1%的幾率會出現嵌合體序列,所以在16S 擴增子測序的分析中,需要去除嵌合體序列

參考文章:http://drive5.com/usearch/manual/chimera_formation.html

24、嵌合體序列