25、轉錄本(transcript)組成(gtf文件的第三列)
轉錄本(transcript)長度範圍 3214482 到3671498
3214482--3216021----3216022--3216024----3216025--3216968----3421702--3421901----3670552--3671348----3671346--3671348----3671349--3671498
3UTR stop_codon CDS3 | | CDS2 | | CDS1 start_codon 5UTR
| | | |
3214482------------------------------------------------------------3216968----3421702--3421901----3670552-----------------------------------------------------------3671498
exon3(3UTR,stop_codon, CDS3) exon3(CDS2) exon1(5UTR,stop_codon, CDS1)
解釋 transcript、UTR、stop_codon、exon、CDS、start_codon關系
CDS,是編碼一段蛋白產物的序列。cds必定是一個orf。但也可能包括很多orf。反之,每個orf不一定都是cds。 開放閱讀框(ORF)是基因序列的一部分,有內含子的
25、轉錄本(transcript)組成(gtf文件的第三列)