初學javascript的時候也跟題主一樣搞不清楚，自己好好總結了一下：

首先，要明確幾個點：
1.在JS裏，萬物皆對象。方法（Function）是對象，方法的原型(Function.prototype)是對象。因此，它們都會具有對象共有的特點。
即：對象具有屬性__proto__，可稱為隱式原型，一個對象的隱式原型指向構造該對象的構造函數的原型，這也保證了實例能夠訪問在構造函數原型中定義的屬性和方法。

2.方法(Function)
方法這個特殊的對象，除了和其他對象一樣有上述_proto_屬性之外，還有自己特有的屬性——原型屬性（prototype），這個屬性是一個指針，指向一個對象，這個對象的用途就是包含所有實例共享的屬性和方法（我們把這個對象叫做原型對象）。原型對象也有一個屬性，叫做constructor，這個屬性包含了一個指針，指回原構造函數。

好啦，知道了這兩個基本點，我們來看看上面這副圖。
1.構造函數Foo()
構造函數的原型屬性Foo.prototype指向了原型對象，在原型對象裏有共有的方法，所有構造函數聲明的實例（這裏是f1，f2）都可以共享這個方法。

2.原型對象Foo.prototype
Foo.prototype保存著實例共享的方法，有一個指針constructor指回構造函數。

3.實例
f1和f2是Foo這個對象的兩個實例，這兩個對象也有屬性__proto__，指向構造函數的原型對象，這樣子就可以像上面1所說的訪問原型對象的所有方法啦。

另外：
構造函數Foo()除了是方法，也是對象啊，它也有__proto__屬性，指向誰呢？
指向它的構造函數的原型對象唄。函數的構造函數不就是Function嘛，因此這裏的__proto__指向了Function.prototype。
其實除了Foo()，Function(), Object()也是一樣的道理。

原型對象也是對象啊，它的__proto__屬性，又指向誰呢？
同理，指向它的構造函數的原型對象唄。這裏是Object.prototype.

最後，Object.prototype的__proto__屬性指向null。

總結：
1.對象有屬性__proto__,指向該對象的構造函數的原型對象。
2.方法除了有屬性__proto__,還有屬性prototype，prototype指向該方法的原型對象。

function Foo(){}
var foo = new Foo()
Foo.prototype.__proto__ === Object.prototype //true 理由同上
 

 function Bar(){}
//這時我們想讓Foo繼承Bar
Foo.prototype = new Bar()
 Foo.prototype.__proto__ === Bar.prototype //true

js中__proto__和prototype的區別和關系？

__proto__和prototype