R中seurat等問題學習
1.Seurat
轉自:https://cloud.tencent.com/developer/article/1055892
# Initialize the Seurat object with the raw (non-normalized data). Keep all # genes expressed in >= 3 cells (~0.1% of the data). Keep all cells with at # least 200 detected genes pbmc <- CreateSeuratObject(raw.data = pbmc.data, min.cells = 3, min.genes = 200, project = "10X_PBMC")
這裡的min.genes是對細胞來說的,過濾掉那些檢測到基因個數少於200的細胞。保留>=200的吧。
min.cells=200,包含那些基因,至少在200個細胞裡表達了。
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