虛擬篩選依賴分子模擬技術，從大量的有機化合物中遴選出可能有效的候選化合物，避免了對化合物的盲目篩選，從而大大降低了發現活性先導化合物的成本。虛擬篩選作為計算機輔助藥物設計中的一項實用化技術，在當代的創新葯物研發中發揮著重要的作用。

近些年來，國內外針對一些重大疾病藥物靶標均有許多成功使用虛擬篩選的例項。在這些成功的例項中，多種不同型別的小分子化合物資料庫（通常包括100,000~1000,000個化合物）被用於虛擬篩選，從中獲得了生物活性達到μM甚至nM級別的結構新穎的活性先導化合物。
    

在此基礎上，選擇合適的小分子化合物庫不僅能極大的提升工作效率同時能節省工作時間、購買費用等。本文簡單介紹一些虛擬篩選的小分子化合物庫。

常用資料庫：

ZINC、PubChem、DrugBank、ChEMBL、ChemDB、HMDB、BindingDB、SMPDB。

常用化合物庫介紹：

1）篩選化合物庫分類：多樣性化合物庫、上市藥物分子庫、已知活性庫、靶點化合物庫，天然產物庫，片段庫等等；

2） 常用化合物庫品牌：Chemdiv、Enamine、Lifechemicals、Specs、Chembridge、Maybridge、Microsource 、Vitas-M、Interbioscreen等； 

3） 各品牌化合物的優劣勢介紹

a.ChemDiv：140萬庫存分子，多樣性被認為是商業庫中最好的，每年新增20萬以上的分子，每年新增的量就和Specs全部的分子數一樣多了，而且有很多虛擬篩選的針對各靶點的子庫，被大量的高通量篩選的客戶選用。到貨很快，快的時候1周就可以到貨了;

b.Enamine：100萬以上，烏克蘭的公司，多樣性也不錯，但價格要高於chemdiv；

c.Lifechemicals：60多萬種分子，庫存量充足，如部分產品庫存不足可很快完成合成及補充工作，進入中國市場較晚，價格中等；

d.SPEC：20多萬種分子，價格最便宜，最早進入中國市場，已經被各大研究單位無數次的反覆篩選過。近年有些研究單位實驗結果顯示：沒有新的化合物已經有將近10年未更新化合物，溶解性，多樣性都相對比較差；

e.Chembridge：有70萬種小分子，將化合物分成1，2，3 或4類，價格都不一樣，是依賴於化合物合成的難易來分的。相對價格較貴;

f.Maybridge：只有6萬種小分子，雜環化合物比較多，但因為定價最高，選擇的人相對較少，同時到貨週期也比較慢；

因為各化合物庫供應商的定價政策是：單次購買化合物數量越多價格越便宜。所以直接使用各化合物庫公司自己的電子資料並在單次篩選中儘量選用一個公司的分子庫最好。這樣既可以避免找不到實體化合物的情況,還能降低化合物單價及運費操作費。

使用大部分虛擬篩選軟體的過程中，我們經常會遇到一個重複操作的步驟，新增化合物資料庫！第一次虛篩結果不好，重新新增；引數選錯了，重新新增。。。麻煩哈！

有時候，我們想同時篩選多個化合物資料庫，包括自己的化合物資料庫。我們得提前把所有資料整合在一起，或者，篩選多次。。。麻煩哈！

沒關係！沒關係！

藥物篩選管理系統——既提供化合物庫資源管理，可以同時選擇商業資料庫和自己得私有化合物庫，又提供虛擬篩選及實體篩選資料管理，可以整合篩選過程所涉及到的多樣化資料。

藥物篩選管理系統（DSMS）是一款綜合虛擬篩選與實體篩選的藥物篩選資料管理系統，內建化合物資源庫，為大規模化合物高通量篩選提供資料管理一站式解決方案，加速藥物發現。該系統整合虛擬篩選、實體篩選及化合物資源三大模組，資料相互關聯。

基於相似性原理，從化合物資源庫中查詢相似化合物，從而進行生物實驗驗證，並將篩選資料通過實體篩選模組管理，一個活性化合物發現多個活性化合物，實現一站式科研資料管理。

藥物篩選管理系統功能介紹

可篩選庫

DSMS 可篩選庫分為組織庫和系統庫。系統內建化合物資源庫，包括藥物庫，天然產物庫，合成化合物庫等，無縫對接化合物供應商，為使用者購買化合物提供便捷服務；也支援管理本地化合物資源庫。

內嵌結構編輯器

內嵌自主研發的impDraw化學結構編輯器，可在系統內繪製及編輯化合物的結構或反應式。

查詢功能

支援子結構查詢、精確結構查詢和相似度查詢，每秒可檢索 20 萬個化學結構。

虛擬篩選管理

系統提供分子拓撲相似和三維形狀相似兩種方法，使用者可以根據自己需求靈活選擇。DSMS篩選化合物是非常快速的，篩選數百萬化合物只需幾分鐘。系統提供篩選報告下載功能，在篩選結果的分子庫資訊中資料可批量儲存和匯出。

實體篩選管理管理

對化合物及其生物活性篩選資料進行管理，支援分子水平、細胞水平、動物水平等不同層次藥物篩選的資料管理；提供藥物實體篩選資訊批量儲存與查詢模組，可靈活配置相關模組的欄位資訊，進行實體篩選資訊的便捷儲存與快速查詢。還可批量新增分子和匯入虛擬篩選分子及實體篩選分子，而且匯入記錄可查詢。

虛擬篩選作為新葯研發的加速器，其篩選化合物庫的選擇也是重中之重。藥物篩選管理系統作為一款專業的篩選管理系統，融合虛擬篩選和實體篩選資料系統化管理，提供化合物庫，實現一站式科研資料管理，是新葯研發的一大利器。