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阿新 • • 發佈：2018-12-31
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- 資料視覺化基本套路總結
- 你知道R中的賦值符號箭頭
<-和等號=的區別嗎？ - 使用dplyr進行資料操作30例
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- 4向量、矩陣的數學運算
- 5控制結構
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- 7認識迴圈函式lapply和sapply
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- 3工具箱—誤差線、加權數、展示資料分佈
- 4語法基礎
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- 6標度、軸和圖例
- 7定位-分面和座標系
- 8主題設定、儲存匯出
- 9繪圖需要的資料整理技術
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高階統計繪圖：
- 28個實用繪圖包，總有幾個適合你
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- 聚類分析factoextra
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一作解讀
一作解讀專欄，由論文第一，或共同第一作者，來親自講述文章結果和背後的故事。
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- Microbiome：中國科學家完成雞腸道微生物巨集基因集的構建(張和平、魏泓、秦楠點評)
- Gut：人體最初的微生物起源與生殖健康 孕期健康對孩子至關重要
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- 中國微生物組計劃—農作物微生物組
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文獻精讀
精讀主要是指全文翻譯，一字不落的閱讀，通常字數過萬
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- Nature：面板微生物群-宿主相互作用
- Nature綜述：人類微生物培養及培養組學culturomics
- NRM: 藍藻水華的形成機理及防治動態
- NRM: 擁抱未知-解析土壤微生物組的複雜性
- NRM: 追“根”溯源：植物根際的微生物生態
- NRM 關鍵物種對於微生物菌群結構和功能的驅動作用
- NRM：多年凍土的微生物組
- Nat Rev Gastroenterol Hepatol: 給醫生的菌群分析指南上 下
- PNAS: 乾旱延緩高粱根系微生物組的建成並富集革蘭氏陽性菌
- NAR：MicrobiomeAnalyst微生物組分析師——統計、視覺化和元分析微生物組資料的網頁工具
- Nature綜述：微生物的社交網路 - 營養缺陷型如何塑造複雜群落
- Cell綜述：人類腸道菌群-從關聯到調控
- Cell ：根部微生物跨界的互作促進擬南芥生存
- Cell Host綜述-建立因果關係：合成菌群在植物菌群研究中的機會
- 對菌群影響藥效和毒性的全面總結
綜述泛讀
- Cell: 巨集基因組學成為病毒分類新方法
- Nat Rev Microbiol：呼吸道菌群—呼吸道健康的守門人
- Nature綜述——真菌的多樣性：真菌的高通量測序及鑑定
- Nat. Plant: 可持續農業生態系統中的核心微生物組
- Cell：代謝控制中的腦腸軸
- Cell:人體腸道細菌與自身細胞的比例究竟是多少？
- COM: 土壤微生物組——從巨集基因組學到巨集表型組學
- Ann. Rev.：植物微生物組—系統見解與展望
- Ann. Rev.：微生物組與人
- 微生物組學與植物病害微生物防治
- 組學重建真菌現有分類系統
- FEMS: 森林微生物組多樣性，複雜性和動態變化
- Nature Microbiology: 微生物資料的系統發育分析方法
- Protein&Cell|解析宿主基因組和微生物的複雜互作
- Microbiome|植物內部微生物的相互作用
- 微生物組學研究的可再現性、可重現性、穩定性與普適性
- TPS：植物相關微生物群在傳統草藥中的作用
- Nature Microbiology：微生物與海洋全球變化
高分文章套路解讀
- NBT：根際微生物組抗番茄枯萎病 PPT思路梳理
- Nature：益生菌清除致病菌的機制 科普：原來益生菌是這麼搞定致病菌的
- Nature: 高通量細菌分離培養鑑定
- Nature：根系菌群參與磷脅迫和免疫的平衡
- Nature: EMP揭示地球多尺度微生物多樣性
- Nature：環境vs基因，誰對腸道菌群影響更大？
- Nature：人類腸道微生物組的腸型
- Nature：如何做一篇腸道菌群免疫的頂級文章-高鹽與高血壓
- Nature：腸道菌群代謝物調節腸道與免疫
- Nature: 擬南芥根微生物組的結構和組成
- Nature: 地球上最古老的熱液噴口發現早期生命跡象
- Nature: 甘露糖苷選擇性抑制致病性大腸桿菌
- Nature：乙酸鹽通過介導微生物-腦-β細胞軸促進代謝綜合徵
- Nature：人工甜味劑改變小鼠腸道菌群組成及功能
- Nature：土壤細菌具有多種合成次級代謝物的基因
- Nature: 海洋病毒對環境基因組和潛在的生物地球化學影響
- TM：巨集基因組學揭示海洋微生物及其病毒的生態學
- Nature綜述：巨集基因組時代的病毒分類
- Nature：全球表層土微生物組群落結構和功能
- Nature-2018-抗菌藥物組合有望特異性治療耐多藥性的細菌感染
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- NC.：降低微生物群落複雜度突破組裝難題
- NC：巨集基因組學提示曙古菌門的代謝和進化(中大李文均組)
- NM：植物根系分泌物影響菌群結構
- NM：丰度決定了細菌在複雜群落中的功能作用
- CHM:小腸菌群與脂肪的消化和吸收密切相關
- GigaScience:植物MWAS研究—穀子產量與微生物組關聯分析
- Microbiome：微生物組研究中你必須注意的細節
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- Microbiome：植物根際微生物組也有晝夜節律
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- Microbiome: 植物生態位和基因型對微生物的影響
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- Microbiome: 絕對定量環境樣本細菌、真菌、真核群落丰度
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- PNAS-2018-病原菌在植物免疫下的轉錄組
- PNAS-2018-根系分泌物香豆素調控微生物群落結構並促進植物健康
- PNAS-2018-玉米根際的大規模田間重複研究確定可遺傳的微生物 方法解讀
- PNAS-2017-人工構建玉米極簡微生物組
- PNAS: 兒童生長髮育遲緩 = 長期飢餓？
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- PBio-2018：如何設計可預測植物表型的微生物組
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