胸部CT影像分析(筆記)
大家看看這張醫學影象是用什麼演算法實現分割的?歡迎積極交流討論。
分析:右邊的結果及各個顏色的比例是左邊CT(或者HRCT)影象經過CALIPER(one of CT scan scoring system)處理得到的。
CALIPER 官網:https://imbio.com/portfolio
下面是我對肺部加偽彩色增強的結果:
基於閾值或基於紋理特徵都很難實現上述分割,經過多次測試、調研及討論,得出結論:傳統的方法是做不到的,應該是在大量標註資料上用深度學習進行訓練,才能對肺部軟組織進行分類。
CALIPER 或者 Visual CT Score 在網上沒有下載到,可以試下免費的醫學影像分析軟體3D Slicer 外加兩個肺部影像分析擴充套件包Chest Imaging Platform (CIP)和Slicer-AirwaySegmentation,下面給出下載連結:
3D Slicer 下載連結:https://www.slicer.org/
Slicer 安裝後在其選單欄view->Extensions Manager
搜尋Chest Imaging Platform (CIP)和Slicer-AirwaySegmentation安裝。
3D Slicer技術文件:http://www.slicer.org/slicerWiki/index.php/Documentation/4.8
Chest Imaging Platform (CIP)技術文件:https://chestimagingplatform.org/documentation
Chest Imaging Platform (CIP)可實現的功能截圖如下:
Chest Imaging Platform (CIP)使用截圖
Slicer-AirwaySegmentation技術文件:https://www.slicer.org/wiki/Documentation/Nightly/Modules/AirwaySegmentation#Tutorials
Slicer-AirwaySegmentation使用截圖