使用Anaconda進行環境和包的管理
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使用conda
首先我們將要確認你已經安裝好了conda -
配置環境
下一步我們將通過建立幾個環境來展示conda的環境管理功能。使你更加輕鬆的瞭解關於環境的一切。我們將學習如何確認你在哪個環境中，以及如何做複製一個環境作為備份。 -
測試Python
然後我們將檢查哪一個版本的python可以被安裝，以及安裝另一個版本的python，還有在兩個版本的python之間的切換。 -
檢查包
1)我們將羅列出安裝在我們電腦上的包2)瀏覽可用的包
3)使用conda install命令來來安裝以及移除一些包
4)對於一些不能使用conda安裝的包，我們將在Anaconda.org網站上搜索
5)對於那些在其它位置的包，我們將使用pip命令來實現安裝。我們還會安裝一個可以免費試用30天的商業包IOPro
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移除包、環境以及conda
管理conda：
檢查conda版本:
conda --version- 1
- 1
升級當前版本的conda
conda update conda- 1
- 1
管理環境
建立並激活一個環境
使用”conda create”命令，後邊跟上你希望用來稱呼它的任何名字：
conda create --name snowflake biopython- 1
- 1
這條命令將會給Biopython建立一個新的環境，位置在Anaconda安裝檔案的/envs/snowflakes
啟用這個新環境
- Linux，OS X:
source activate snowflakes- 1
- 1
- Windows：
activate snowflake- 1
- 1
小技巧：
新的開發環境會被預設安裝在你conda目錄下的envs檔案目錄下。你可以指定一個其他的路徑；去通過 conda create -h瞭解更多資訊吧。
小技巧：
如果我們沒有指定安裝python的版本，conda會安裝我們最初安裝conda時所裝的那個版本的python。
列出所有的環境
conda info -envis或者(-e)- 1
- 1
* 注意：conda有時也會在目前活動的環境前邊加上號。**
切換到另一個環境(activate/deactivate)
為了切換到另一個環境，鍵入下列命令以及所需環境的名字。
- Linux，OS X:
source activate snowflakes- 1
- 1
- Windows：
activate snowflakes- 1
- 1
如果要從你當前工作環境的路徑切換到系統根目錄時，鍵入：
- Linux，OS X:
source deactivate- 1
- 1
- Windows:
deactivate- 1
- 1
複製一個環境
通過克隆來複制一個環境。這兒將通過克隆snowfllakes來建立一個稱為flowers的副本。
conda create -n flowers --clone snowflakes- 1
- 1
通過
conda info –-envs- 1
- 1
來檢查環境
刪除一個環境
如果你不想要這個名為flowers的環境，就按照如下方法移除該環境：
conda remove -n flowers
- 1
- 2
- 1
- 2
管理Python
安裝一個不同版本的python
現在我們假設你需要python3來編譯程式，但是你不想覆蓋掉你的python2.7來升級，你可以建立並激活一個名為snakes的環境，並通過下面的命令來安裝最新版本的python3：
conda create -n snakes python=3- 1
- 1
檢查新的環境中的python版本
確保snakes環境中執行的是python3：
python --version- 1
- 1
使用不同版本的python
為了使用不同版本的python，你可以切換環境，通過簡單的啟用它就可以，讓我們看看如何返回預設版本
- Linux，OS X:
source activate - snowflakes- 1
- 1
- Windows：
activate snowflakes- 1
- 1
登出該環境
當你完成了在snowflakes環境中的工作室，登出掉該環境並轉換你的路徑到先前的狀態：
- Linux，OS X：
source deactivate- 1
- 1
- Windows：
deactivate- 1
- 1
管理包
- conda安裝和管理python包非常方便，可以在指定的python環境中安裝包，且自動安裝所需要的依賴包，避免了很多拓展包衝突相容問題。
- 不建議使用easy_install安裝包。大部分包都可以使用conda安裝，無法使用conda和anaconda.org安裝的包可以通過pip命令安裝
- 使用合適的源可以提升安裝的速度
檢視已安裝包
使用這條命令來檢視哪個版本的python或其他程式安裝在了該環境中，或者確保某些包已經被安裝了或被刪除了。在你的終端視窗中輸入：
conda list- 1
- 1
向指定環境中安裝包
使用Conda命令安裝包
我們將在指定環境中安裝這個Beautiful Soup包，有兩種方式:
- 直接指定-n 指定安裝環境的名字
conda install --name bunnies beautifulsoup4- 1
- 1
* 提示：你必須告訴conda你要安裝環境的名字（-n bunies）否則它將會被安裝到當前環境中。*
- 啟用bunnies環境，再使用conda install命令。
activate bunnies
conda install beautifulsoup4- 1
- 2
- 1
- 2
2.從Anaconda.org安裝一個包
如果一個包不能使用conda安裝，我們接下來將在Anaconda.org網站查詢。
在瀏覽器中，去 Anaconda資源官網 。我們查詢一個叫“bottleneck”的包，所以在左上角的叫“Search Anaconda Cloud”搜尋框中輸入“bottleneck”並點選search按鈕。
Anaconda.org上會有超過一打的bottleneck包的版本可用，但是我們想要那個被下載最頻繁的版本。所以你可以通過下載量來排序，通過點選Download欄。
點選包的名字來選擇最常被下載的包。它會連結到Anaconda.org詳情頁顯示下載的具體命令：
conda install--channel https：//conda .anaconda.ort/pandas bottleneck- 1
- 1
3. 通過pip命令來安裝包
對於那些無法通過conda安裝或者從Anaconda.org獲得的包，我們通常可以用pip命令來安裝包。
可以上pypi網
站查詢要安裝的包，查好以後輸入pip install命令就可以安裝這個包了。
我們啟用想要放置程式的python環境，然後通過pip安裝一個叫“See”的程式。
- Linux，OS X：
source activate bunnies- 1
- 1
- Windows：
activate bunnies- 1
- 1
所有平臺：
pip install see- 1
- 1
提示：pip只是一個包管理器，所以它不能為你管理環境。pip甚至不能升級python，因為它不像conda一樣把python當做包來處理。但是它可以安裝一些conda安裝不了的包。
4. 檔案安裝
如果真的遇到走投無路的境地，也就是上面這些方法通通不管用！！！那就只能下載原始碼安裝了，比如exe檔案（雙擊安裝）或者whl檔案（pip安裝）等等。還有在github上找到原始碼，使用python setup.py install命令安裝
Tips:不建議使用setuptools 的easy_install，非常不方便管理，也不好解除安裝
有些時候，Anaconda和pip下載的速度慢，訪問不穩定怎麼辦？換個源唄，清華大學的源就很不錯，當然啦，你可以自己google一些好用的源
對於包管理工具，瞭解這麼多就夠了，比較喜歡追根究底的童鞋可以移步包管理工具解惑
**提示：
在任何時候你可以通過在命令後邊跟上-help來獲得該命令的完整文件。
**
eg:
conda update --help- 1
- 1
* 小技巧：*
很多跟在–後邊常用的命令選項，可以被略寫為一個短線加命令首字母。所以–name選項和-n的作用是一樣的。通過conda -h或conda
–-help來看大量的縮寫。
移除包、環境、或者conda
如果你願意的話。讓我們通過移除一個或多個試驗包、環境以及conda來結束這次測試指導。
移除包
假設你決定不再使用商業包IOPro。你可以在bunnies環境中移除它。
conda remove -n bunnies iopro- 1
- 1
移除環境
我們不再需要snakes環境了，所以輸入以下命令：
conda remove -n snakes --all- 1
- 1
刪除conda
- Linux，OS X：
移除Anaconda 或 Miniconda 安裝資料夾
rm -rf ~/miniconda - 1
- 1
OR
rm -rf ~/anaconda- 1
- 1
- Windows：
去控制面板，點選“新增或刪除程式”，選擇“Python2.7（Anaconda）”或“Python2.7（Miniconda）”並點選刪除程式。