（網易雲課堂，騰訊課堂生物資訊講師，高階生物資訊工程師）

第一章——Linux常用命令

1. 目錄和檔案管理

1.1目錄相關

1.1.1 mkdir(make directory)

功能說明：建立目錄

語法：mkdir [-p] <dir1 [dir2 …]>

參數：-p 若所要建立目錄的上層目錄目前尚未建立，則會一併建立上層目錄。

Example ：mkdirtestdir

mkdir -p newdir/childdir

1.1.2 rmdir(remove directory)

功能說明：刪除（空）目錄

補充說明：該命令只能刪除空目錄，若要刪除非空目錄，請使用

語法：rmdir [-p] <dir1 [dir2…]>

參數：-p刪除指定目錄後，若該目錄的上層目錄已變成空目錄，則將其一併刪除。

Example ：rmdirtestdir

rmdir -p childdir

1.1.3 ls(list)

功能說明：列出目錄內容

語法：ls [-alhtr]<file/dirname>

參數：-a 顯示目錄下所有檔案和目錄（顯示隱藏檔案和目錄）。

-l 顯示檔案/目錄詳細資訊，每行顯示一個檔案/目錄。

-h 檔案大小按’K’，’M’，’G’，來顯示（需要加 -l 引數）。

-t 用檔案和目錄的更改時間排序。

-r 反向排序

Example ：ls -a dirname

ls -lh dirname

ls -ltr dirname

補充說明：ll 並不是linux 下的基本命令，實際上是ls–l 的一個別名（縮寫），別名可在~/.bashrc中使用alias定義，

如alias ll=’ls –l’

1.1.4 cd(change directory)

功能說明：切換目錄

語法：cd <dirname>

Example ：cd /path/dirname/

特殊例子：cd / 轉換到根目錄

cd ~ 轉換到家目錄（即/home/yourname/）

cd ../ 轉換到上一級目錄

cd - 轉換到上一次cd前所在的目錄

1.1.5 pwd(print working directory)

功能說明：顯示工作目錄絕對路徑

語法：pwd

Example ：pwd

特殊目錄的表示：

/ 根目錄

~ 家目錄

./ 當前目錄

../ 上一級目錄

特殊說明：linux 下以”.”開頭的檔名為隱藏檔案，使用ls -a時才會顯示

1.2 檔案處理

1.2.1 touch

功能說明：建立一個空檔案或者更改檔案修改時間

語法：touch <filename>

Example ：touchnewfile 建立一個名為newfile的空檔案

1.2.2 cp(copy)

功能說明：複製檔案或目錄

語法：cp [-r] <source file/dirname> < destination file/dirname>

參數：-r/-R 將一個目錄及目錄內所有檔案複製到另一個目錄

Example ：cp file1file2 將file1複製並重命名為file2

cp file1 file2 dirname/ 將file1，file2複製到一個目錄下

cp -r dir1 dir2 若dir2已存在，dir1複製到dir2下，若不存在，dir1複製並重命名為dir2

1.2.3 mv(move)

功能說明：移動或更名現有的檔案或目錄。

語法：mv <source file/dirname> < destinationfile/dirname>

Example ：mv file1file2 將file1重新命名為file2

mv file1 file2 dirname/ 將file1，file2移動到dirname/目錄下

mv dir1 dir2 若目錄dir2已存在，dir1移動到dir2下，若dir2不存在，dir1移動並重命名為dir2

1.2.4 rm(remove)

功能說明：刪除目錄或檔案

語法：rm [-r] <file1/dir1 [file2/dir2 …]>

參數：-r/-R 刪除目錄和該目錄下的所有檔案

Example ：rm file1 [file2 …] 刪除file1[file2 …]

rm -r dir1 [dir2 …] 刪除dir1 [dir2 …] 目錄及目錄下所有檔案

1.2.5 less

功能說明：檢視檔案內容

語法：less [-SN] <file1 [file2 …]>

參數：-S 每行不顯示長於螢幕寬度的字元（預設顯示在下一行）

-N 顯示行號

Example ：less -S file

less -SN file

補充說明：使用less 開啟檔案後，使用ctrl+u向上翻頁，ctrl+d向下翻頁，/pattern可以進行向下匹配查詢，?pattern

可以進行向上匹配查詢。使用“q”退出。

1.2.6 more

功能說明：顯示檔案內容

語法：more <file1 [file2…]>

Example ：more file

補充說明：使用more 顯示檔案內容後，"enter"往下移動一行，使用空格鍵“space”向下翻頁，使用“q”退出

1.2.7 head

功能說明：顯示檔案開頭部分

語法：head [-n] <file1 [file2…]>

參數：-n <number> 顯示檔案頭number行的內容（預設顯示頭10行）

Example ：headfile 顯示file檔案的頭10行的內容

head -n 100 file 顯示file檔案頭100行的內容

1.2.8 tail

功能說明：顯示檔案末尾部分

語法：tail [-n] <file1 [file2…]>

參數：-n <number> 顯示檔案末尾number行的內容（預設顯示末尾10行）

Example ：tail file 顯示file檔案的末尾10行的內容

tail -n 100 file 顯示file檔案末尾100行的內容

1.2.9 cut

功能說明：顯示檔案每行指定範圍的字元

語法：cut [-cdf] <file>

參數：-c num1-num2，顯示每行從開頭算起第num1到num2的字元

-d 指定域分割符，預設“\t”

-f num1-num2，顯示每行從開頭算起第num1到num2的域

Example ：cut -c 1-10 file 顯示檔案file每行開頭的10個字元

cut -f 1-10 file 顯示檔案file每行開頭10列（以“\t”分割）

cut -d “ ” -f 2 顯示檔案file第二列（以空格分割）

1.2.10 cat（concatenate）

功能說明：將檔案連線後顯示到標準輸出（或使用“>”重定向到其他檔案）

語法：cat [-n] <file [file2…]> [> newfile]

參數：-n 在檔案內容前加行號顯示

Example ：catfile 將file檔案的內容顯示到螢幕。

cat -n file > newfile 將file內容加行號後重定向到newfile中。

cat file1 file2 > newfile 將file1和file2的內容重定向到newfile。

cat file1 file2 >> file 將file1和file2的內容追加到file檔案的末尾。

cat > file

new word

生成file檔案並將“new word”新增到檔案中。

1.2.11 ln（link）

功能說明：連結目錄或檔案

語法：ln [-s] <source file/dirname> [file/dirname]

參數：-s 對目標檔案進行符號連結而非硬連結

Example ：ln -s file1 file2 將file1連結為file2（注：file2必須不存在）

ln -s file1 file2 dirname/ 將file1和file2連結到dirname/下