1. 程式人生 > >ubuntu下使用github安裝R Packages[已解決]

ubuntu下使用github安裝R Packages[已解決]

安裝packages失敗:
提示錯誤為:

package ‘****’ is not available (for R version 3.1.2) 
Solved:
使用github的安裝方式:
  1. 先安裝好devtools:
    * Installing devtools Package *
    While many R packages are hosted on CRAN and can be installed using the built-in install.packages() function, there are many more packages that are hosted on GitHub but are not on CRAN. To install R packages from GitHub, we need to use the devtools R package, so let’s install it.

The devtools R package requires three system packages to be installed on the Droplet, namely libcurl4-gnutls-dev, libxml2-dev, and libssl-devc. Install these three packages:

$ sudo apt-get -y install libcurl4-gnutls-dev libxml2-dev libssl-dev

Now the devtools R package can be installed. Remember that we want to install it using the same method as described above, rather than install it within an R session, because devtools should be available to all users.

R > install.packages('devtools', repos='http://cran.rstudio.com/')
  1. 碰見問題:
> devtools::install_github(c('IRkernel/IRdisplay', 'IRkernel/IRkernel'))
Downloading GitHub repo IRkernel/[email protected]
from URL https://api.github.com/repos/IRkernel/IRdisplay/zipball/master
Installing IRdisplay
Error in
if (capabilities("libcurl")) { : argument is of length zero
解決方式:
$ sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev libxml2-dev libxslt-dev libssl-dev -y
$ sudo apt-get install r-base r-base-dev -y
$ R
...
> options(repos='http://cran.rstudio.com/')
> install.packages("devtools")
> install.packages(c('repr', 'pbdZMQ', 'devtools'))
> options(download.file.method = "wget")
> install.packages('RCurl')
> devtools::install_github(c('IRkernel/IRdisplay', 'IRkernel/IRkernel'))
> IRkernel::installspec()

3.安裝packages: 比如installr

if (!require('devtools')) install.packages('devtools'); # make sure you have Rtools installed first! if not, then run:
#install.packages('installr')
#install.Rtools()
devtools::install_github('talgalili/installr')
Ref:

相關推薦

ubuntu使用github安裝R Packages[解決]

安裝packages失敗: 提示錯誤為: package ‘****’ is not available (for R version 3.1.2) Solved: 使用github的安裝方式: 先安裝好devtools: * Install

Ubuntu環境GitHub安裝與使用

process 兩種 ted 上傳 config err touch .com cte 安裝git sudo apt-get update sudo apt-get install git 1 2 1 2 配置 你的github git config --glo

ubuntu mysql安裝以後無法登陸的的解決方法((ERROR 1698 (28000): Access denied for user 'root'@'localhost'))

sta mysql安裝 nat where 數據 move sel 方法 client 1. 刪除mysql sudo apt-get autoremove --purge mysql-server-5.0 sudo apt-get remove

解決ubuntu 用anaconda 安裝R 語言後,無法安裝R語言package的問題

info={ 系統:ubuntu 17.10 } 錯誤提示 * installing *source* package ‘quadprog’ ... ** 成功將‘quadprog’程式包解包並MD5和檢查 ** libs /home/longsent/anaconda3/bin/

windows安裝fbprophet(解決visual studio 2014報錯問題)

本人使用windows10 64位,python3.5.2,anaconda3.5.3,安裝這個機車的函式包,累計耗時快10個小時,總是會有各種錯誤。最後終於成功[]~( ̄▽ ̄)~* 首先需要保證安裝中共已安裝visual studio 2015中的C++模組,然後要保證python中已安裝以下

【完全解決Ubuntu正確安裝VMware Tools及安裝搜狗輸入法

安裝 VMware Tools 時報 客戶機作業系統已將 CD-ROM 門鎖定,並且可能正在使用CD-ROM 的解決方法,很多新手都遇到過 解決方法:1.關閉虛擬機器2.編輯虛擬機器,將CD/DV

UbuntuMATLAB安裝 + Jpyter notebook + 一些小問題的解決

1.MATLAB的安裝 ubuntu14.04 自帶的 gcc 版本是 4.8,MATLAB2014a支援的最高版本為4.7x。因此,需要安裝gcc4.7,並給gcc降級! 首先,在終端執行gcc 4.7的安裝命令: sudo apt-get upda

解決 VirtualBox 中 Ubuntu 無法安裝增強功能異常

今天在 VirtualBox 中安裝了 Ubuntu 作為虛擬機器開發環境,途中安裝 VirtualBox 提供的增強功能,但是報錯,截圖如下: 這樣的問題乍一看很奇怪,檔案系統無法識別。其實只需要重新安裝一下 linux 映像就行,執行這條命令:

Ubuntu無法安裝sun-java6-jdk的解決辦法

安裝 sun-java6-jdk出現以下錯誤 [email protected]:/home# sudo apt-get install sun-java6-jdk Reading package lists... Done Building dependency tree Reading s

解決Ubuntu安裝AndroidStudio,Logcat無輸出,AndroidProfile無輸出的問題

作業系統:Ubuntu16.04 LTSIDS:AndroidStudio 3.1.3原因非常簡單,因為Ubuntu是新安裝的,因此其實系統中並沒有安裝 adb相關的包。但是這個問題我也是找了很久都沒有發現,直到最後自己想要手工重啟一下adb服務,才發現的:完成安裝後,問題就

Ubuntu Eclipse 安裝SVN

path size add library 內容 svn 註意 -- xms 如果尚未安裝Eclipse,先安裝;也可以直接下載Google提供的ADT Bundle。 sudo apt-get install eclipse 安裝Subversion sudo apt-g

ubuntuapache2 安裝 配置 卸載 CGI設置 SSL設置

handler lin usr you none 找到 權限 apt view 一、安裝、卸載apache2 apache2可直接用命令安裝 sudo apt-get install apache2 卸載比較麻煩,必須卸幹凈,否則會影

ubuntutensorflow安裝

fcm rtu 真的 版本 rac ade start dev gin 先說點題外話:在用anaconda安裝很多次tensorflow失敗之後,我放棄了,如果你遇到這樣的問題:Traceback (most recent call last)…如果不是因為pip版本,就放

UbuntuClickHouse安裝

all ipv4 keys /var/ sql 如果 art 有一個 分享 ClickHouse目前僅支持在ubuntu下面部署,而且國內中國文檔也比較少 >vi /etc/apt/sources.list #在最後一行追加 #ubuntu16.04 使用Xenial

ubuntuPycharm安裝及配置

字體大小 creat 配置 註冊 字體 spa tar.gz mark 註冊碼 1.從http://www.jetbrains.com/pycharm/download/下載最新的Pycharm tar xfz pycharm-*.tar.gz,將Pycharm文件夾解壓到

Ubuntu Apache安裝和配置2

spl pac ubuntu server ould start warn it works apache。 在Ubuntu上安裝Apache,有兩種方式:1 使用開發包的打包服務,例如使用apt-get命令;2 從源碼構建Apache。本文章將詳細描述這兩種不同的安裝方式

Ubuntu 14.04 安裝 CUDA 問題及解決

default isp 命令行 cuda lsp nds /dev/ 解決 eset http://www.cnblogs.com/gaowengang/p/6068788.html 本文安裝環境: - 雙顯卡: intel 集顯 + nvidia 獨顯 - Ubuntu

centos和ubuntupycharm無法輸入中文的解決辦法

添加 div /usr usr 網上 pycha 編輯 ibus code 編輯啟動的腳本文件 vim /usr/bin/pycharm ubuntu下添加 export GTK_IM_MODULE=fcitx export QT_IM_MODULE=fcit

Ubuntunagios安裝(來源官網)

update gawk ibm plain cert lib account adding resolv Ubuntu下nagios安裝(來源官網) https://assets.nagios.com/downloads/nagioscore/docs/nagioscore

Ubuntupython3安裝tkinter包

pan run 安裝完成 ref http blank 如果 case python3 case1: 首先sudo apt-get update(如果不更新很有可能找不到tkinter),然後sudo apt-get install python3-tk,安裝完成後就可