Tomcat是Apache基金會提供的Servlet容器，它支援JSP, Servlet和JDBC等J2EE關鍵技術，所以使用者可以用Tomcat開發基於資料庫，Servlet和JSP頁面的Web應用，這是沒有問題的。
但是，Tomcat卻不是EJB容器；也就是說，Tomcat不支援J2EE的重要技術之一，EJB。那麼，使用EJB元件開發的Web應用程式就無法在Tomcat下面執行。眾所周知，EJB是分散式應用程式的核心技術，所以說凡是需要使用EJB來開發的應用（例如，銀行、電信等大型的分散式應用系統）就不能用Tomcat了。這也就是很多公司不選擇Tomcat的原因。
至於支援EJB的應用伺服器，Weblogic( Oracle), WebSphere（IBM)和JBoss( Redhat)都是符合J2EE規範的EJB容器，所以都可以用來開發大型的分散式應用程式。

所以，原則上來說，只要你要開發基於EJB元件的應用，上述三種任選一個都是可以的。唯一的區別是，Weblogic和WebSphere都是付費的，JBoss是開源免費的。
很多公司為了省錢，選擇了JBoss作為應用伺服器，但是，開源免費也就意味著廠商不會為終端使用者直接負責；所以，當JBoss伺服器出現任何問題......元芳，你怎麼看？
總的來說，Weblogic和WebSphere還有JBoss都有人用，但是很多公司拿著這些大玩意兒實際上乾的也只是Tomcat級別的專案，所以如此一來，差別也就不大了