技術標籤：lammps建模

前幾天參考Eric N. Hahn大神的in檔案內的石墨烯建模發了一個LAMMPS命令建模模板的推文，由於本人太懶，沒仔細檢查，不好意思了~後面網友提醒，其中的C原子的排列規則定義有問題，形狀沒問題但是C-C之間的距離卻遠小於1.4埃，後經過檢測，發現這是由於沒有加units metal指令，而LAMMPS預設的units型別是lj，從而會導致這種詭異的問題，之前若對你們造成了困惑，在此表示歉意~。感謝網友“人生何處不清衫的提醒了”~

更新後的模板如下所示：

#注：本模板中的模型參考於昨天Eric N. Hahn大神的in檔案中構建石墨烯模型的部分
units           metal 
#units型別根據具體模型進行選取~
boundary        p p p  
#週期性條件和採用其它邊界條件所構建的模型也有區別，根據情況選取，LAMMPS預設三個方向均為週期性~
atom_style      atomic
#告訴LAMMPS你的模型中包含什麼（鍵角，電荷還是隻有原子）
lattice         custom 2.4595 a1 1.00000 0 0 &
                a2 0 1.73203 0 &
                basis 0 0 0  &
                basis 0.5 0.16666666666666666 0 &
                basis 0.5 0.5 0 &
                basis 0 0.6666666666666666 0
#定義原子排列規則
region        box block  -210 210 -240 240 -5 200 units lattice
#劃分盒子區域
create_box    1 box
#定義盒子內包含的原子種數
region          graphene block  -210 210 -240 240 0 0.1 units lattice
#在盒子內劃出一個區域
create_atoms    1 region graphene
#按照定義好的原子排列規則在graphene區域中填充型別1的原子
mass            * 12.011
#定義原子質量
write_data      struc.lmp
#輸出LAMMPS可以讀取的data檔案