前言 轉錄組
阿新 • • 發佈:2018-08-19
部分 陣列 推斷 void 相同 所有 start 組成 oid
轉錄組
轉錄組(Transcriptome),廣義上指在相同環境(或生理條件)下的一個細胞、或一群細胞中所能轉錄出的所有RNA的總和,包括 信使RNA(mRNA)、核糖體RNA(rRNA)、轉運RNA(tRNA)以及非編碼RNA(ncRNA);狹義上則指轉錄出的信使RNA(mRNA)。
轉錄組學
轉錄組學(Transcriptomics),是分子生物學的一個分支,研究在單個細胞或特定類型細胞/組織/器官或發育階段的細胞群內所生產的各類RNA分子的類型和數量。
轉錄組測定的是樣本表達的基因豐度及其類型(例如,可變剪切)。每個細胞裏面的每一種mRNA分子的平均數稱為該種mRNA的豐度,根據豐度可把mRNA群體分為兩大類:
- 高豐度mRNA,通常由細胞裏不到100種的mRNA(每種mRNA分子拷貝數為1000~10000)組成,占總mRNA的50%左右。
- 稀有mNRA,或復雜mRNA,由長度不等的種類繁多的序列組成,每種序列只有少量的拷貝。
高豐度mRNA在不同類型細胞中有很大區別。例如,卵清蛋白只在輸卵管細胞裏合成而不在肝臟內合成,其mRNA占輸卵管細胞mRNA總量的一半,但高豐度mRNA只占基因表達數的很小一部分。
稀有mRNA大部分是許多,甚至是所有類型細胞所共有的,包括了各種類型細胞所需的功能。編碼這種類型的功能的基因,有時被稱為“持家基因”或“組成型基因”,;編碼特定細胞特定功能的基因,稱為“奢侈基因”。
研究方法
- DNA微陣列技術(又名,基因芯片)
- RNA測序
應用
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幹細胞和癌細胞轉錄組研究可以幫助研究人員了解細胞分化和癌變過程
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分析人類卵母細胞和胚胎的轉錄組用於了解控制早期胚胎發育的分子機制和信號通路,理論上可以成為在體外人工受精中進行適當胚胎選擇的有力工具
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用於新藥研究或化學品的安全性風險評估
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推斷系統發育關系
參考資料
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前言 轉錄組