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生信學習-二代測序知乎專欄總結[轉]

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轉自:https://zhuanlan.zhihu.com/p/20702684

1.基本概念

  • flowcell 是指Illumina測序時,測序反應發生的位置,1個flowcell含有8條lane
  • lane 每一個flowcell上都有8條泳道,用於測序反應,可以添加試劑,洗脫等等
  • tile 每一次測序熒光掃描的最小單位
  • reads 指測序的結果,1條序列一般稱為1條reads
  • bp base pair 堿基對,用於衡量序列長度
  • 雙端測序 只一條序列可能比較長如500bp,我們可以兩端每端各測150bp
  • junction 上面說的雙端測序,中間會留有200bp測不到的東西,我們叫junction
  • adapter
    就是測序中需要的一段特定的序列,有類似於引物的功能
  • primer PCR中的引物

cDNA:complementary DNA互補脫氧核糖核酸。以一種逆轉錄酶,以mRNA為模板做成的復制品,將真核生物的基因(以mRNA的形式)復制到原核生物細胞中。

似乎看懂了,明天總結一下,並且看一下pdf!!!

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