生信學習-二代測序知乎專欄總結[轉]
轉自:https://zhuanlan.zhihu.com/p/20702684
1.基本概念
- flowcell 是指Illumina測序時,測序反應發生的位置,1個flowcell含有8條lane
- lane 每一個flowcell上都有8條泳道,用於測序反應,可以添加試劑,洗脫等等
- tile 每一次測序熒光掃描的最小單位
- reads 指測序的結果,1條序列一般稱為1條reads
- bp base pair 堿基對,用於衡量序列長度
- 雙端測序 只一條序列可能比較長如500bp,我們可以兩端每端各測150bp
- junction 上面說的雙端測序,中間會留有200bp測不到的東西,我們叫junction
- adapter
- primer PCR中的引物
cDNA:complementary DNA互補脫氧核糖核酸。以一種逆轉錄酶,以mRNA為模板做成的復制品,將真核生物的基因(以mRNA的形式)復制到原核生物細胞中。
似乎看懂了,明天總結一下,並且看一下pdf!!!
生信學習-二代測序知乎專欄總結[轉]
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